Lectina tipo C
Unha lectina tipo C (CLEC) é un tipo de dominio proteico de unión a carbohidratos de proteínas lectinas.[2] A designación tipo C refírese ao seu requirimento de calcio para unirse.[3] As proteínas que conteñen dominios de lectina tipo C teñen unha gama diversa de funcións incluíndo a adhesión célula a célula, resposta inmune a patóxenos e apoptose.[4][5]
dominio de lectina tipo C | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | |||||||||||
Símbolo | Lectin_C | ||||||||||
Pfam | PF00059 | ||||||||||
InterPro | IPR001304 | ||||||||||
SMART | CLECT | ||||||||||
PROSITE | PS50041 | ||||||||||
SCOPe | 2msb / SUPFAM | ||||||||||
CDD | cd00037 | ||||||||||
|
Clasificación
editarDrickamer et al. clasificaron as lectinas tipo C en 7 subgrupos (do I ao VII) baseándose na orde de varios dominios proteicos en cada proteína.[6] Esta clasificación foi posteriormente actualizada en 2002, engadíndose a ela sete subgrupos adicionais (do VIII ao XIV).[7] Máis recentemente, engadíronse tres subgrupos máis (do XV ao XVII).[2]
Grupo | Nome | Dominios asociados |
---|---|---|
I | Lecticanas | EGF, dominios Sushi Ig e Link |
II | Asialoglicoproteína e receptores DC | Ningún |
III | Colectinas | Ningún |
IV | Selectinas | dominios Sushi e EGF |
V | receptores da célula NK | Ningún |
VI | receptores endocíticos multi CTLD | dominios FnII e Ricin |
VII | grupo Reg | Ningún |
VIII | Condrolectina, Layilina | Ningún |
IX | Tetranectina | Ningún |
X | Policistina | dominios WSC, REJ, PKD |
XI | Atractina (ATRN) | dominios PSI, EGF e CUB |
XII | Proteína básica maior eosinófila (EMBP) | Ningún |
XIII | DGCR2 | Ningún |
XIV | Trombomodulina, CD93, CD248 | dominio EGF |
XV | Bimlec | Ningún |
XVI | SEEC | dominios SCP e EGF |
XVII | CBCP/Frem1/QBRICK | dominios de repeticións CSPG e CalX-beta |
Entre os CLEC están os seguintes:
- CLEC1A, CLEC1B
- CLEC2A, CLEC2B, CD69 (CLEC2C), CLEC2D, CLEC2L
- CLEC3A, CLEC3B
- CLEC4A, CLEC4C, CLEC4D, CLEC4E, CLEC4F, CLEC4G, ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
- CLEC5A
- CLEC6A
- CLEC7A
- OLR1 (CLEC8A)
- CLEC9A
- CLEC10A
- CLEC11A
- CLEC12A, CLEC12B
- CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
- CLEC14A
- CLEC16A
- CLEC17A
Os "receptores de tipo lectina da célula NK" están moi estreitamente relacionados con este grupo:[8]
- KLRA1
- KLRB1 (CLEC5B)
- KLRC1, KLRC2, KLRC3, KLRC4
- KLRD1
- KLRF1 (CLEC5C)
- KLRG1 (CLEC15A), KLRG2 (CLEC15B)
- KLRK1
Outras proteínas que conteñen este dominio son:
- AGC1; ATRNL1
- BCAN
- CD248; CD72; CD93; CHODL; CL-K1-Ia; CL-K1-Ib; CL-K1-Ic; CLECSF5; COLEC10; COLEC11; COLEC12; CSPG3
- FCER2; FREM1; HBXBP;
- LAYN; LOC348174; LOC728276
- MAFA; MBL2; MGC34761; MICL; MRC1L1
- OLR1
- PAP; PKD1; PKD1L2; PLA2R1; PRG2; PRG3
- REG1A; REG1B; REG3A; REG3G; REG4
- SELE; SELL; SELP; SFTPA1; SFTPA2; SFTPA2B; SFTPD; SRCL
- THBD
- VCAN
Notas
editar- ↑ Walker JR, Nagar B, Young NM, Hirama T, Rini JM (April 2004). "X-ray crystal structure of a galactose-specific C-type lectin possessing a novel decameric quaternary structure". Biochemistry 43 (13): 3783–92. PMID 15049685. doi:10.1021/bi035871a.
- ↑ 2,0 2,1 Zelensky AN, Gready JE (December 2005). "The C-type lectin-like domain superfamily". FEBS J. 272 (24): 6179–217. PMID 16336259. doi:10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x.
- ↑ C-Type Lectin Medical Subject Headings (MeSH) na Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA.
- ↑ Drickamer K (October 1999). "C-type lectin-like domains". Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. PMID 10508765. doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3.
- ↑ Cambi A, Figdor C (May 2009). "Necrosis: C-type lectins sense cell death". Curr. Biol. 19 (9): R375–8. PMID 19439262. doi:10.1016/j.cub.2009.03.032.
- ↑ Drickamer K (1993). "Evolution of Ca(2+)-dependent animal lectins". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology 45: 207–32. ISBN 978-0-12-540045-9. PMID 8341801. doi:10.1016/S0079-6603(08)60870-3.
- ↑ Drickamer K, Fadden AJ (2002). "Genomic analysis of C-type lectins". Biochem. Soc. Symp. (69): 59–72. PMID 12655774.
- ↑ NK Cell Lectin-Like Receptors Medical Subject Headings (MeSH) na Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA.
Véxase tamén
editarLigazóns externas
editar- Functional Glycomics Gateway, unha colaboración entre o Consortium for Functional Glycomics e o Nature Publishing Group