Abrir o menú principal

SMART (do inglés Simple Modular Architecture Research Tool, Ferramenta de Investigación da Arquitectura Modular Simple) é unha base de datos biolóxica que se utiliza na identificación e análise de dominios proteicos en secuencias proteicas.[1][2] SMART utiliza modelos de Markov de perfís ocultos construídos a partir de aliñamentos de secuencias múltiples para detectar dominios proteicos en secuencias proteicas. A versión máis recente de SMART contén 1.009 modelos de dominios.[3] Os datos de SMART foron utilizados para crear a colección da Conserved Domain Database (Base de datos de Dominios Conservados) e tamén se distribúe como parte da base de datos InterPro.[4] A base de datos albérgase no European Molecular Biology Laboratory (EMBL, Laboratorio de Bioloxía Molecular Europeo) en Heidelberg, Alemaña.

NotasEditar

  1. Schultz J, Milpetz F, Bork P, Ponting CP (May 1998). "SMART, a simple modular architecture research tool: identification of signaling domains". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (11): 5857–64. PMC 34487. PMID 9600884. doi:10.1073/pnas.95.11.5857. 
  2. Letunic I, Doerks T, Bork P (January 2009). "SMART 6: recent updates and new developments". Nucleic Acids Res. 37 (Database issue): D229–32. PMC 2686533. PMID 18978020. doi:10.1093/nar/gkn808. 
  3. Letunic I, Doerks T, Bork P (January 2012). "SMART 7: recent updates to the protein domain annotation resource". Nucleic Acids Res. 40 (Database issue): D302–5. PMC 3245027. PMID 22053084. doi:10.1093/nar/gkr931. 
  4. Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, et al. (September 2002). "InterPro: an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites". Brief. Bioinformatics 3 (3): 225–35. PMID 12230031. doi:10.1093/bib/3.3.225. 

Véxase taménEditar

Ligazóns externasEditar