InterPro: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
m Bot: Engado {{Control de autoridades}}; cambios estética
Liña 65:
;[[PROSITE]] : É unha base de datos de familias e dominios de proteínas. Consta de sitios bioloxicamente significativos das proteínas, patróns e perfís que axudan a identificar con fiabilidade a que familia coñecida (se existe) pertence unha nova secuencia.
;[[Simple Modular Architecture Research Tool|SMART]] : Permite a identificación e anotación de dominios xeneticamente móbiles e a análise de arquitecturas de dominios. Son detectables máis de 800 familias de dominios que se encontran en proteínas asociadas coa [[cromatina]], a sinalización, e extracelulares. Estes dominios están amplamente anotados en canto á súa distribución filética, clase funcional, estruturas terciarias e residuos importantes funcionalmente.
;[[SUPERFAMILY (base de datos)|SUPERFAMILY]] : É unha biblioteca de perfís de modelos de Markov ocultos que representan todas as proteínas de estrutura descoñecida. A biblioteca está baseada na clasificación [[Structural Classification of Proteins (base de datos)|SCOP]] das proteínas: cada modelo corresponde a un dominio SCOP e pretende representar a [[superfamilia proteica|superfamilia]] SCOP completa á que pertence o dominio. SUPERFAMILY foi utilizada para realizar asignacións estruturais de todos os xenomas completamente secuenciados.
;[[TIGRFAMs]] : É unha colección de familias de proteínas, que presenta aliñamentos de secuencias múltiples revisados, modelos de Markov ocultos e anotacións, que proporciona unha ferramenta para identificar proteínas funcionalmente relacionadas baseadas na homoloxía de secuencia. Estas entradas, que son o que se chama "equivalogs", agrupan proteínas homólogas que están conservadas con respecto á súa función.
 
Liña 148:
| pmid = 12364791
| doi = 10.1126/science.1076181
|bibcode = 2002Sci...298..129H | display-authors = 29 }}</ref> En febreiro de 2013, a versión pública de InterProScan (v4.x) estaba [[Perl|baseada en Perl]], aínda que unha nova arquitectura baseada en [[linguaxe Java|Java]] está baixo desenvolvemento, e formará o núcleo de InterProScan v5.<ref name=i5codebase>https://code.google.com/p/interproscan/</ref>
 
InterPro ten como obxectivo poñer novos datos en dominio público cada 8 semanas, tipicamente un día despois da aparición en [[UniProtKB]] dos datos das mesmas proteínas.
Liña 157:
== Véxase tamén ==
=== Ligazóns externas ===
* [http://www.ebi.ac.uk/interpro/ Páxina web oficial] &mdash; servidor web
* [ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro bases de datos] &mdash; descarga FTP
* [http://www.ebi.ac.uk/training/online/course/interpro-quick-tour InterPro QuickTour en EBI Train OnLine]
{{Control de autoridades}}
 
 
[[Categoría:Bases de datos biolóxicas]]