Northern blot: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 18:
O northern blot permite a observación do patrón de expresión dun xene particular en distintos tecidos, órganos, estadios do desenvolvemento, niveis de estrés ambiental, infeccións de patóxenos, e ao longo do curso dun tratamento.<ref name="Mori1991" /><ref name="Liang1995" /><ref name=Baldwin1999>Baldwin, D., Crane, V., Rice, D. (1999) A comparison of gel-based, nylon filter and microarray techniques to detect differential RNA expression in plants. Current Opinion in Plant Biol. 2: 96–103.</ref> A técnica foi utilizada para mostrar a sobreexpresión de [[oncoxene]]s e a [[regulación da expresión xénica|regulación]] á baixa de xenes supresores de tumores en células cancerosas cando se comparan co tecido "normal",<ref name="Streit2009" /> e tamén a expresión xénica no rexeitamento de órganos transplantados.<ref name=Utans1994>{{Cita publicación periódica | last1 = Utans | first1 = U. | last2 = Liang | first2 = P. | last3 = Wyner | first3 = L. R. | last4 = Karnovsky | first4 = M. J. | last5 = Russel | first5 = M. E. | year = 1994 | title = Chronic cardiac rejection: Identification of five upregulated genes in transplanted hearts by differential mRNA display | url = | journal = Proc. Natl. Acad. Sci. USA | volume = 91 | issue = 14| pages = 6463–6467 | doi = 10.1073/pnas.91.14.6463 | pmid = 8022806 | pmc = 44222}}</ref> Se se observa que un [[xene]] é regulado porque se detecta unha abundancia do seu ARNm no northern blot feito á mostra, este xene pode despois ser secuenciado para determinar se é un xene coñecido polos investigadores ou se é un descubrimento novo.<ref name="Utans1994" /> Os patróns de expresión obtidos baixo unhas condicións determinadas pode servir para comprender mellor a función dese xene. Como o ARN se separa primeiro por tamaños, en caso de que se use só un tipo de sonda as variacións no nivel de cada banda na membrana poden dar unha idea do tamaño do produto, o que pode suxerir a existencia de produtos de [[splicing alternativo]] do mesmo xene ou motivos de secuencia repetidos.<ref name="Durand1993" /><ref name="Gortner1996" /> A variación en tamaño dun produto dun xene pode tamén indicar [[deleción]]s ou erros no [[procesamento do ARN|procesamento do transcrito]]. Alterando a diana da sonda utilizada na secuencia coñecida, é posible determinar que rexión do ARN se perdeu.<ref name="Alberts2008" />
 
[http://www.medicalgenomics.org/Databases/blotbase/news BlotBase] é unha base de datos online que publica northern blots. BlotBase leva publicados uns 700 northern blots de mostras humanas e de ratos, duns 650 xenes de máis de 25 tipos de [[tecido (bioloxía)|tecido]].<ref name="Schlamp2008" /> Os northern blots poden buscarse na base de datos por un ID de blot, referencia de publicación, identificador de xene, ou por tecido.<ref name="Schlamp2008" /> Os resultados dunha búsquedabusca proporcionan a ID de blot, especie, tecido, xene, nivel de expesión, imaxe do blot (se está dispoñible), e ligazóns á publicación do traballo no que se orixinaron os datos.<ref name="Schlamp2008" />
 
== Vantaxes e desvantaxes ==