Prosthecobacter
Clasificación científica
Dominio: Bacteria
Clase: Verrucomicrobiae
Orde: Verrucomicrobiales
Familia: Verrucomicrobiaceae
Xénero: Prosthecobacter
Staley et al. 1976 ex Staley et al. 1980[1]
Especie tipo
Prosthecobacter fusiformis
Staley et al. 1976 ex Staley et al. 1980
Especies
Sinonimia

Prosthecobacter é un xénero de bacterias do filo Verrucomicrobiota que presenta unha característica moi distintiva; posúe xenes similares aos da tubulina. As proteínas tubulinas son compoñentes dos microtúbulos, que nunca foran observadas antes en bacterias Gracilicutes.

Durante moito tempo pensouse que a tubulina era específica de eucariotas. Porén, máis recentemente, viuse que varias proteínas procariotas estaban relacionadas coa tubulina.[2][3][4][5]

A maioría das bacterias teñen unha proteína homóloga chamada FtsZ. As Prosthecobacter son a excepción a isto porque conteñen xenes que teñen unha maior homoloxía de secuencia coa tubulina eucariota que coa FtsZ.

Estes xenes denomínanse tubulina bacteriana a (BtubA) e tubulina bacteriana b (BtubB). As súas propiedades non son exactamente as mesmas. Con todo, os seus bucles de superficie e microtúbulos son extremadamente similares.

Filoxenia

editar

A taxonomía actualmente aceptada está baseada na LPSN[1] e o NCBI[6]

Baseada no ARNr 16S do LTP_08_2023[7][8][9] Baseada en 120 proteínas marcadoras do GTDB 08-RS214[10][11][12]
Prosthecobacter

P. fluviatilis Takeda et al. 2008

P. vanneervenii Hedlund et al. 1998

Brevifollis gellanilyticus Otsuka et al. 2013

P. debontii Hedlund et al. 1998

P. dejongeii Hedlund et al. 1998

P. algae Lee et al. 2014

P. fusiformis Staley et al. 1976 ex Staley et al. 1980

Prosthecobacter

P. vanneervenii

Brevifollis gellanilyticus

P. debontii

P. dejongeii

P. fusiformis

  1. 1,0 1,1 J.P. Euzéby. "Prosthecobacter". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Consultado o 2022-09-09. 
  2. Nogales E, Downing KH, Amos LA, Löwe J (xuño de 1998). "Tubulin and FtsZ form a distinct family of GTPases". Nature Structural Biology 5 (6): 451–8. PMID 9628483. doi:10.1038/nsb0698-451. 
  3. Jenkins C, Samudrala R, Anderson I, Hedlund BP, Petroni G, Michailova N, Pinel N, Overbeek R, Rosati G, Staley JT (decembro de 2002). "Genes for the cytoskeletal protein tubulin in the bacterial genus Prosthecobacter". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99 (26): 17049–54. Bibcode:2002PNAS...9917049J. PMC 139267. PMID 12486237. doi:10.1073/pnas.012516899. 
  4. Yutin N, Koonin EV (marzo de 2012). "Archaeal origin of tubulin". Biology Direct 7: 10. PMC 3349469. PMID 22458654. doi:10.1186/1745-6150-7-10. 
  5. Larsen RA, Cusumano C, Fujioka A, Lim-Fong G, Patterson P, Pogliano J (xuño de 2007). "Treadmilling of a prokaryotic tubulin-like protein, TubZ, required for plasmid stability in Bacillus thuringiensis". Genes & Development 21 (11): 1340–52. PMC 1877747. PMID 17510284. doi:10.1101/gad.1546107. 
  6. Sayers; et al. "Prosthecobacter". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado o 2022-09-09. 
  7. "The LTP". Consultado o 20 de novembro de 2023. 
  8. "LTP_all tree in newick format". Consultado o 20 de novembro de 2023. 
  9. "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF). Consultado o 20 de novembro de 2023. 
  10. "GTDB release 08-RS214". Genome Taxonomy Database. Consultado o 10 de maio de 2023. 
  11. "bac120_r214.sp_label". Genome Taxonomy Database. Consultado o 10 de maio de 2023. 
  12. "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Consultado o 10 de maio de 2023.