Obelisco (bioloxía)
En bioloxía, un obelisco é un elemento "similar a un viroide" descrito por primeira vez en xaneiro de 2024 nun artigo prepublicado na revista Nature, cuxos autores dicen que os "obeliscos forman o seu propio grupo filoxenético separado",[1][2][3] xa que as súas secuencias de ARN, descubertas por metatranscriptómica asistida por computador, non son homólogas coas secuencias xenómicas de ningunha outra forma de vida.[1] Actualmente, disponse só duns poucos métodos para a identificación destes elementos a partir de datos de secuenciación da seguinte xeración (NGS).[4]
Como as súas realacións con outros organismos son descoñecidas, son un exemplo de incertae sedis ou "taxons enigmáticos".
Distribución e patoloxía
editarOs obeliscos atopáronse en mostras de feces humanas, e dentro de espécimes da bacteria Streptococcus sanguinis, unha especie de bacterias, que se encontra na boca humana. Sábese que algunhas persoas albergaron obeliscos por máis de 300 días. O estudo inicial mostrou a presenza de obeliscos nun 7 % das mostras fecais, e nun 50 % das mostras de saliva, de individuos que vivían en todos os continentes.[1]
O efecto dos obeliscos sobre a saúde humana, se é que producen algún, está aínda por determinar,[2] igual que os seus ciclos vitais e os factores dos que depende a súa replicación.[1]
Xenética e bioquímica
editarEntre as características dos obeliscos están: teñen ensamblaxes de xenomas de ARN circular con arredor de 1000 pares de bases, e estruturas secundarias con forma de barra ou bacilar que comprenden todo o xenoma. A diferenza dos viroides, o seu ARN é traducido a proteínas, chamadas provisoriamente "oblinas" na prepublicación. As dúas proteínas mencionadas alí chamáronse oblina-1 e oblina-2.[1]
As primeiras predicións estruturais dicen que a oblina-1 pode unirse a ións metálicos e así podería estar implicada na sinalización celular. A oblina-2 presenta un sitio de unión que é típico dos complexos proteicos, e podería, polo tanto, unirse a encimas da célula hóspede.[2]
Nome
editarA prepublicación di: "debido a unha estrutura secundaria fortemente predita como similar á bacilar [de barra], denominamos este grupo de ARNs obelisco-alfa."... "Con 1164 nt de lonxitude, a estrutura secundaria similar á bacilar era sorprendente..."[1] (secundaria con respecto á estrutura da ensamblaxe circular.)
Notas
editar- ↑ 1,0 1,1 1,2 1,3 1,4 1,5 Ivan N. Zheludev; Robert C. Edgar; Maria Jose Lopez-Galiano; Marcos de la Peña; Artem Babaian; Ami S. Bhatt; Andrew Z. Fire (21 de xaneiro de 2024). "Viroid-like colonists of human microbiomes".
- ↑ 2,0 2,1 2,2 Sidik, Saima (29 de xaneiro de 2024). "'Wildly weird' RNA bits discovered infesting the microbes in our guts". Nature. PMID 38291328
|pmid=
incorrecto (Axuda). doi:10.1038/d41586-024-00266-7. Arquivado dende o orixinal o 30 de xaneiro de 2024. Consultado o 31 de xaneiro de 2024. - ↑ Pennisi, Elizabeth (26 de xaneiro de 2024). "'It's insane': New viruslike entities found in human gut microbes". Science. doi:10.1126/science.znxt3dk. Arquivado dende o orixinal o 30 de xaneiro de 2024. Consultado o 31 de xaneiro de 2024.
- ↑ Kremer, Frederico; de Barros, Daniele (2024). "Tormentor: An obelisk prediction and annotation pipeline". BioRxiv.org (BioRxiv). doi:10.1101/2024.05.30.596730. Consultado o 3 de xuño de 2024.