Secuenciación de escopeta: Diferenzas entre revisións

A [[cobertura (xenética)|cobertura]] (profundidade de lectura ou profundidade) é o número medio delecturas que representan un determinado [[nucleótido]] na secuencias reconstruída. Pode calcularse a partir da lonxitude do xenoma orixinal (''G''), o número delecturasde lecturas (''N''), e a lonxitude media das lecturas (''L'') como <math>N\times L/G</math>. Por exemplo, un xenoma hipotético de 2.&nbsp;000 pares de bases reconstruído a partir de 8 lecturas cunha lonxitude media de 500 nucleótidos terá unha redundancia de 2x. Este prámetro tamén permite estimar outras cantidades, como a porcentaxe do xenoma cuberto polas lecturas (ás veces tamén chamada cobertura). UnhaÉ moi interesante que haxa unha alta cobertura na secuenciación de escopeta é moi interesante porque pode superar os erros na ''chamada de bases'' (ou ''[[base calling]]'', a asignación de nucleobases a picos do [[cromatograma]]) e de ensamblaxe. A [[teoría de secuenciación do ADN]] trata das relacións estes estas cantidades.