Abrir o menú principal

Cambios

 
=== Cobertura ===
A [[cobertura (xenética)|cobertura]] (profundidade de lectura ou profundidade) é o número medio delecturas que representan un determinado [[nucleótido]] na secuencias reconstruída. Pode calcularse a partir da lonxitude do xenoma orixinal (''G''), o número delecturas (''N''), e a lonxitude media das lecturas (''L'') como <math>N\times L/G</math>. Por exemplo, un xenoma hipotético de 2.000 pares de bases reconstruído a partir de 8 lecturas cunha lonxitude media de 500 nucleótidos terá unha redundancia de 2x. Este prámetro tamén permite estimar outras cantidades, como a porcentaxe do xenoma cuberto polas lecturas (ás veces tamén chamada cobertura). Unha alta cobertura na secuenciación de escopeta é moi interesante porque pode superar os erros na chamada de bases (ou ''[[base calling]]'', a asignación de nucleobases a picos do [[cromatograma]]) e de ensamblaxe. A [[teoría de secuenciación do DNADN]] trtatrata das relacións estes estas cantidades.
<!--
Ás veces faise unha distinción entre a ''cobertura da secuencia'' e a ''cobertura física''. A cobertura da secuencia é o númeromedionúmero medio de veces que se le unha base (como se describiu antes). A cobertura física é o número medio de veces que se le unha base ou é abranguida por lecturas de pares apareados.<ref name="MeyersonFig1">{{Cite journal | last1 = Meyerson | first1 = M. | last2 = Gabriel | first2 = S. | last3 = Getz | first3 = G. | doi = 10.1038/nrg2841 | title = Advances in understanding cancer genomes through second-generation sequencing | journal = Nature Reviews Genetics | volume = 11 | issue = 10 | pages = 685–696 | year = 2010 | pmid = 20847746| pmc = }}</ref>
 
== Secuenciación de escopeta xerárquica ==
174.328

edicións