Secuenciación de escopeta: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Liña 137:
=== Cobertura ===
A [[cobertura (xenética)|cobertura]] (profundidade de lectura ou profundidade) é o número medio delecturas que representan un determinado [[nucleótido]] na secuencias reconstruída. Pode calcularse a partir da lonxitude do xenoma orixinal (''G''), o número delecturas (''N''), e a lonxitude media das lecturas (''L'') como <math>N\times L/G</math>. Por exemplo, un xenoma hipotético de 2.000 pares de bases reconstruído a partir de 8 lecturas cunha lonxitude media de 500 nucleótidos terá unha redundancia de 2x. Este prámetro tamén permite estimar outras cantidades, como a porcentaxe do xenoma cuberto polas lecturas (ás veces tamén chamada cobertura). Unha alta cobertura na secuenciación de escopeta é moi interesante porque pode superar os erros na chamada de bases (ou ''[[base calling]]'', a asignación de nucleobases a picos do [[cromatograma]]) e de ensamblaxe. A [[teoría de secuenciación do
<!--
Ás veces faise unha distinción entre a ''cobertura da secuencia'' e a ''cobertura física''. A cobertura da secuencia é o
== Secuenciación de escopeta xerárquica ==
|