Electroforese en xel bidimensional: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 37:
 
[[Ficheiro:2D gel images dual channel original.PNG|miniatura|200px|Imaxes de dous xeles de electroforese 2D, recubertos con [http://www.decodon.com/ Delta2D]. A primeira imaxe está coloreada en laranxa, a segunda está coloreada en azul. Debido a diferenzas no avance das moléculas no xel, as manchas correspondentes non se solapan.]]
[[Ficheiro:2D gel images dual channel warped.PNG|miniatura|200px|Imaxes de dous xeles de electroforese 2D. A primeira imaxe está coloreada de laranxa, a segunda en azul. As manchas correspondentes solápanse despois da deformación. As manchas comúns están coloreadas de negro, as manchas laranxas só están presentes (ou son moito máis fortes) na primeira imaxe, as manchas azuis están só presentes (ou son moito máis fortes) na segunda imaxe.]]
 
En [[proteómica cuantitativa]], estas ferramentas analizan primariamente biomarcadores para cuantificar proteínas individuais e mostran a separación entre unha ou máis "manchas " de proteínas nunha imaxe escaneada dun xel bidimensional. Adicionalmente, estas ferramentas establecen as correspondencias entre manchas de xeles de mostras similares para poñer en evidencia, por exemplo, as diferenzas proteómicas entre os estadios iniciais e avanzados dunha enfermidade. Entre os paquetes de [[software]] están Delta2D, ImageMaster, Melanie, PDQuest, Progenesis e REDFIN, entre outros.<ref>Protocols on line [https://www.protocolsonline.com/protein-science/two-dimensional-gel-electrophoresis/ Two-dimensional gel electrophoresis]</ref> Aínda que esta tecnoloxía se utiliza amplamente, a súa intelixencia non foi perfeccionada. Por exemplo, aínda que PDQuest e Progenesis tenden a concordar na cuantificación e análise de manchas de proteínas ben definidas e ben separadas, dan lugar a diferentes resultados e tendencias de análise cando as manchas son menos definidas e menos separadas.<ref>{{cite journal |vauthors=Arora PS, Yamagiwa H, Srivastava A, Bolander ME, Sarkar G |title=Comparative evaluation of two two-dimensional gel electrophoresis image analysis software applications using synovial fluids from patients with joint disease |journal=J Orthop Sci |volume=10 |issue=2 |pages=160–66 |year=2005 |pmid=15815863 |doi=10.1007/s00776-004-0878-0 |url=http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0949265815327391}}</ref>