HomoloGene: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Sen resumo de edición |
|||
Liña 1:
{{en tradución}}
'''HomoloGene'''é unha ferramenta do [[Centro Nacional para a Información Biotecnolóxica]] (NCBI) que é utilizada como sistema de detección automática de [[Homoloxía (bioloxía)|homólogos]] (similitude atribuible á descendencia dun [[antepasado común]]) entre os
O procesamento de HomoloGene consiste na análise de proteínas dos organismos con entrada. As [[homoloxía de secuencias|secuencias]] compaáranse por medio de [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?CMD=Web&LAYOUT=TwoWindows&AUTO_FORMAT=Semiauto&ALIGNMENTS=250&ALIGNMENT_VIEW=Pairwise&CDD_SEARCH=on&CLIENT=web&DATABASE=nr&DESCRIPTIONS=500&ENTREZ_QUERY=%28none%29&EXPECT=10&FILTER=L&FORMAT_OBJECT=Alignment&FORMAT_TYPE=HTML&I_THRESH=0.005&MATRIX_NAME=BLOSUM62&NCBI_GI=on&PAGE=Proteins&PROGRAM=blastp&SERVICE=plain&SET_DEFAULTS.x=41&SET_DEFAULTS.y=5&SHOW_OVERVIEW=on&END_OF_HTTPGET=Yes&SHOW_LINKOUT=yes&GET_SEQUENCE=yes%7Cblastp blastp], despois emparéllaos e agrúpaos utilizando unha árbore taxonómica construída a partir da similitude de secuencias, na que os organismos máis estreitamente relacionados se emparellan primeiro e logo engádense os seguintes á árbore. As aliñacións de proteínas sígnanse ás súas [[secuencia de ADN|secuencias de ADN]] correspondentes; logo, as distancias métricas tales como as de [[Modelo de Jukes & Cantor (1969)|Jukes & Cantor (1969)]] ou a [[taxa Ka/Ks]] tamén se poden calcular.<ref name=pevsner/>
|