DrugBank: Diferenzas entre revisións

'''DrugBank''' é unha [[base de datos]] en liña de acceso libre, completa que contén información de [[fármaco]]s e dianas de fármacos.<ref name="pmid16381955">{{citeCita journalpublicación periódica |title=DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration|last=Wishart|first=DS|author2=Knox C |author3=Guo AC |journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2006|volume=34|issue=Database issue|page=D668-D672|doi=10.1093/nar/gkj067|pmid=16381955 |pmc=1347430|display-authors=etal}}</ref> DrugBank é un recurso tanto [[bioinformática|bioinformático]] coma [[quimioinformática|quimioinformático]] que combina datos detallados de fármacos (é dicir, datos químicos, farmacolóxicos e farmacéuticos) con información completa das dianas de fármacos (é dicir, información de secuencias, estrutura, e rutas).<ref name="pmid16381955" /><ref name="pmid18048412">{{citeCita journalpublicación periódica |title=DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets|last=Wishart|first=DS|author2=Knox C |author3=Guo AC |journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2008|volume=36|issue=Database issue|page=D901–906|doi=10.1093/nar/gkm958|pmid=18048412 |pmc=2238889|display-authors=etal}}</ref> Debido ao amplo ámbito que abrangue e as referencias completas e datos inusualmente ben detallados das descricións, DrugBank é máis parecida a unha enciclopedia de fármacos que a unha simple base de datos. Hai ligazóns a DrugBank para case todos os fármacos mencionados nas wikipedias. DrugBank utilízase amplamente na industria farmacéutica, polos químicos de medicamentos, farmacéuticos, médicos, estudantes e público en xeral. Os seus amplos datos de fármacos e dianas de fármacos permitiron o descubrimento e busca de novos usos para moitos dos fármacos existentes para tratar doenzas raras e de nova identificación.

A última versión que saíu desta base de datos é a 4.0, a cal contén 7677 entradas de fármacos incluíndo 1558 fármacos de [[pequena molécula|pequenas moléculas]] aprobados pola [[FDA]] norteamericana, 155 fármacos biotecnolóxicos ([[proteína]]/[[péptido]]) aprobados pola FDA, 87 [[nutracéutico]]s e uns 6000 [[fármaco experimental|fármacos experimentais]].<ref name="pmid24203711">{{citeCita journalpublicación periódica |title=DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism|last=Law|first=V|autor2=Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS.|journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2014|volume=42|issue=Database issue|page=D1091-7|pmid=24203711|doi=10.1093/nar/gkt1068|pmc=3965102}}</ref> Ademais, contén 4270 proteínas non redundantes (é dicir, secuencias de dianas de fármacos/[[encima]]s/transportadores/carrexadores) que están ligadas ás entradas destes fármacos. [[Ficheiro:DrugBank drugcard.png|miniatura|esquerda|Fig. 1. DrugBank DrugCard.]]

Catro bases de datos adicionais, que son: HMDB,<ref name="pmid18953024">{{citeCita journalpublicación periódica |title=HMDB: a knowledgebase for the human metabolome|last=Wishart|first=DS|autor2=Guo, AC, Eisner, R, Young, N, Gautam, B, Hau, DD, Psychogios, N, Dong, E, Bouatra, S, Mandal, R, Sinelnikov, I, Xia, J, Jia, L, Cruz, JA, Lim, E, Sobsey, CA, Shrivastava, S, Huang, P, Liu, P, Fang, L, Peng, J, Fradette, R, Cheng, D, Tzur, D, Clements, M, Lewis, A, De Souza, A, Zuniga, A, Dawe, M, Xiong, Y, Clive, D, Greiner, R, Nazyrova, A, Shaykhutdinov, R, Li, L, Vogel, HJ, Forsythe, I|journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2009|volume=37|issue=Database issue|page=D603-10|doi=10.1093/nar/gkn810|pmid=18953024|pmc=2686599}}</ref> T3DB,<ref name="pmid19897546">{{citeCita journalpublicación periódica |title=T3DB: a comprehensively annotated database of common toxins and their targets.|last=Lim|first=E|author2=Pon A |author3=Djoumbou Y |author4=Knox C |author5=Shrivastava S |author6=Guo AC |author7=Neveu V |author8=Wishart DS. |journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2010|volume=38|issue=Database issue|page=D781-6|doi=10.1093/nar/gkp934|pmid= 19897546|pmc=2808899}}</ref> SMPDB <ref name="pmid24203708">{{citeCita journalpublicación periódica |title=Small Molecule Pathway Database.|last=Jewison|first=T|author2=Su Y |author3=Disfany FM |journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2014|volume=42|issue=Database issue|page=D478-84|doi=10.1093/nar/gkt1067|pmid=24203708 |pmc=3965088|display-authors=etal}}</ref> e FooDB, forman tamén parte do paquete xeral de bases de datos [[metabolómica]]s/[[quimioinformática]]s. A HMDB contén información equivalente de máis de 40000 [[metabolito]]s humanos, T3DB contén información de 3100 [[toxina]]s comúns e [[contaminante]]s ambientais, SMPDB contén diagramas de rutas de case 700 [[vía metabólica|vías metabólicas]] humanas e vías de enfermidades, e FooDB contén información equivalente sobre ~28000 compoñentes de alimentos e [[aditivo alimentario|aditivos alimentarios]].

A primeira versión de DrugBank saíu en 2006.<ref name="pmid16381955" /> Este primeiro lanzamento contiña unha cantidade de información relativamente modesta con só 841 fármacos de moléculas pequenas aprobados pola FDA e 113 fármacos biotecnolóxicos. Tamén incluía información sobre 2133 dianas de fármacos. Asegunda versión de DrugBank saíu en 2009.<ref name="pmid18048412" /> Esta versión moi ampliada e mellorada da base de datos incluía xa 1344 fármacos de pequenas moléculas aprobados e 123 fármacos biotecnolóxicos, xunto con 3037 dianas de fármacos únicas. A versión 2.0 tamén incluía por primeira vez [[fármaco retirado|fármacos retirados]] e [[droga ilegal|drogas ilegais]], e ampla información sobre interaccións alimentos-fármacos e fármaco-fármaco e parámetros [[ADME]]T (absorción, distribución, [[metabolismo]], excreción e [[toxicidade]]). A versión 3.0 apareceu en 2011.<ref name="pmid21059682">{{citeCita journalpublicación periódica |title=DrugBank 3.0: a comprehensive resource for 'omics' research on drugs.|last=Knox|first=C |author2=Law, V |author3=Jewison, T |author4=Liu, P |author5=Ly, S |author6=Frolkis, A |author7=Pon, A |author8=Banco, K |author9=Mak, C |author10=Neveu, V |author11=Djoumbou, Y |author12=Eisner, R |author13=Guo, AC |author14=Wishart, DS.|journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2011|volume=39|issue=Database issue|page=D1035–41|doi=10.1093/nar/gkq1126|pmid=21059682|pmc=3013709}}</ref> Esta versión contiña 1424 fármacos de pequenas moléculas aprobados e 132 fármacos biotecnolóxicos e >4000 dianas de fármacos únicas. A versión 3.0 tamén inclúe datos de transportes de fármacos, datos de rutas de fármacos, prezos de fármacos, patentes e datos de fabricación e datos sobre >5000 fármacos experimentais. A versión 4.0 apareceu en 2014.<ref name="pmid24203711" /> Nesta versión inclúense 1558 fármacos de pequenas moléculas aprobados pola FDA, 155 fármacos biotecnolóxicos e 4200 dianas de fármacos únicas. A versión 4.0 tamén incorporou ampla información sobre [[metabolito]]s fármacos (estruturas e reaccións), taxonomía de fármacos, espectros de fármacos, constantes de afinidade de fármacos e información sobre síntese de fármacos. A Táboa 1 proporciona un resumo estatístico máis completo da historia do desenvolvemento de DrugBank.