Wikipedia

InterPro: Diferenzas entre revisións

Explorar o historial de forma interactiva
← Edición máis vellaEdición máis nova →
Contido eliminado Contido engadido
VisualTexto wiki
Miguelferig (conversa | contribucións)
242.353 edicións
Miguelferig (conversa | contribucións)
242.353 edicións
Liña 65:
;ProDom : Base de datos de dominios proteicos que consta dunha compilación automática de dominis homólogos. As versións actuais de ProDom constrúense usando un procedemento novo baseado en buscas PSI-BLAST recursivas.
;[[PROSITE]] : É unha base de datos de familias e dominios deproteínas. Consta de sitios bioloxicamente significativos das proteínas, patróns e perfís que axudan a identificar con fiabilidade a que familia coñecida (se existe) pertence unha nova secuencia.
;[[Simple Modular Architecture Research Tool|SMART]] : Permite a identificación e anotación de dominios xeneticamente móbiles e a análise de arquitecturas de dominios. Son detectables máis de 800 familias de dominios que se encontran en proteínas asociadas coa [[cromatina]], a sinalización, e extracelulares. Estes dominios están amplamente anotados en canto á súa distribución filética, clase funcional, estruturas terciarias e residuos importantes funcionalmente.
;[[Simple Modular Architecture Research Tool|SMART]] : allows the identification and annotation of genetically mobile domains and the analysis of domain architectures. More than 800 domain families found in signalling, extracellular and chromatin-associated proteins are detectable. These domains are extensively annotated with respect to phyletic distributions, functional class, tertiary structures and functionally important residues.
;[[SUPERFAMILY]] : isÉ aunha librarybiblioteca ofde perfís de profilemodelos hiddende Markov modelsocultos thatque representrepresentan alltodas proteinsas ofproteínas de knownestrutura structuredescoñecida. TheA librarybiblioteca isestá basedbaseada onna theclasificación [[Structural Classification of Proteins database(base de datos)|SCOP]] classificationdas of proteinsproteínas: each modelcada correspondsmodelo tocorresponde a SCOPun domaindominio and aimsSCOP toe representpretende therepresentar entire SCOPa [[Proteinsuperfamilia superfamilyproteica|superfamilysuperfamilia]] thatSCOP thecompleta domainá belongsque topertence o dominio. SUPERFAMILY has beenfoi usedutilizada topara carryrealizar outasignacións structuralestruturais assignmentsde totodos allos completelyxenomas sequencedcompletamente genomessecuenciados.
;[[TIGRFAMs]] : is a collection of protein families, featuring curated multiple sequence alignments, hidden Markov models (HMMs) and annotation, which provides a tool for identifying functionally related proteins based on sequence homology. Those entries which are "equivalogs" group homologous proteins which are conserved with respect to function.
 
Traído desde «https://gl.wikipedia.org/wiki/InterPro»