InterPro: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Liña 61:
;[[PANTHER]] : É unha gran colección de familias proteicas que foron subdivididas en subfamilias relacionadas funcionalmente, usando expertos humanos. Estas subfamilias modelizan a diverxencia de funcións específicas en familias proteicas, o que permite unha asociación máis precisa coa súa función (con funcións moleculares revisadas por persoas e clasificacións de procesos biolóxicos e diagramas de vías), e tamén a inferencia dos aminoácidos que son importantes para a especificidade funcional. Constrúense modelos de Markov ocultos (HMMs) para cada familia e subfamilia para clasificar secuencias de proteínas adicionais.
;[[Pfam]] : É unha gran colección de [[aliñamento de secuencias múltiples|aliñamentos de secuencias múltiples]] e modelos de Markov ocultos que abranguen moitos dominios proteicos comúns e familias proteicas.
;PIRSF : O sistema de clasificación de proteínas é unha rede con moitos niveis de diversidade de secuencia de superfamilias e subfamilias que reflicte as relacións [
;[[PRINTS]] : É un compendio de "pegadas dactilares" (''fingerprints'') de proteínas. Unha "pegada dactilar" é un grupo de motivos conservados usados para caracterizar unha familia proteica; o seu poder diagnóstico é refinado por un escaneado iterativo de UniProt. Usualmente os motivos non se solapan, senón que están separados ao longo da secuencia, aínda que poden tamén ser contiguos no espazo tridimensional. Estas ''pegadas dactilares" poden codificar [[pregamento de proteínas|pregamentos de proteínas]] e funcionalidades de xeito máis flexible e potente do que se pode con motivos únicos, e a súa gran potencia de diagnóstico deriva do contexto mutuo
;ProDom : domain database consists of an automatic compilation of homologous domains. Current versions of ProDom are built using a novel procedure based on recursive PSI-BLAST searches.
;[[PROSITE]] : is a database of protein families and domains. It consists of biologically significant sites, patterns and profiles that help to reliably identify to which known protein family (if any) a new sequence belongs.
| |||