Hibridación ADN-ADN: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 20:
== Substitución pola secuenciación do xenoma ==
 
CriticsOs arguecríticos thatdeste themétodo techniqueconsideran isque inaccurateesta fortécnica comparisoné ofinadecuada closelypara relateda speciescomparación de especies estreitamente relacionadas, asxa anyque attemptcalquera tointento measurede differencesmedir betweenas diferenzas entre secuencias [[orthologousortólogo|ortólogas]] sequencesentre betweenorganismos organismsqueda isimpedida overwhelmedpola byabrumadora thehibridación hybridizationde ofsecuencias [[paralogousparálogo|parálogas]] sequencesno within[[xenoma]] andun organism's genomeorganismo.<ref>[http://personal.uncc.edu/jmarks/DNAHYB/Dnahyb2.html DNA hybridization in the apes – Technical issues]</ref> DNAA sequencing[[secuenciación andde computationalADN]] comparisonse ofa sequencesposterior iscomparación nowcomputacional generallydas thesecuencias methodé foragora determiningo geneticmétodo distancexeralmente usado para determinar a distancia xenética entre especies, althoughaínda theque techniquea istécnica stillclásica usedaínda inse usa en microbioloxía microbiologypara toaxudar helpa identifyidentificar bacteriabacterias.<ref>{{cite journal| title=Use of checkerboard DNA–DNA hybridization to study complex microbial ecosystems| author=S.S. Socransky, A.D. Haffajee, C. Smith, L. Martin, J.A. Haffajee, N.G. Uzel, J. M. Goodson| journal=Oral Microbiology and Immunology| year=2004| volume=19| issue=6| pages=352–362| doi=10.1111/j.1399-302x.2004.00168.x| pmid=15491460}}</ref>
 
TheA modernestratexia approachmoderna isé tolevar carrya outcabo DNA–DNAa hybridizationhidridación ADN–ADN ''in silico'' using(nocomputador) completely or partiallyusando [[Wholesecuenciación genomede xenomas sequencingcompletos|sequencedxenomas genomessecuenciados]] total ou parcialmente.<ref name="doi10.1186/1471-2105-14-60">{{cite journal|authors = Meier-Kolthoff JP, Auch AF, Klenk HP, Goeker M|title=Genome sequence-based species delimitation with confidence intervals and improved distance functions|journal=BMC Bioinformatics|volume=14|pages=60|year=2013|doi=10.1186/1471-2105-14-60|url=http://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-14-60}}</ref> TheA ferramenta [http://ggdc.dsmz.de GGDC] developeddesenvolvida atpor [[DSMZ]] isé thea mostferramenta accuratemáis knownprecisa toolcoñecida forpara calculatingcalcular DDH-analogousvalores valuesanálogos DDH.<ref name="doi10.1186/1471-2105-14-60" /> AmongEntre otheroutras algorithmicmelloras improvementsalgorítmicas, itresolve solves the problem witho paralogousproblema sequencesdas bysecuencias carefullyparálogas filteringao themfiltralas fromcoidadosamente thedas matchescoincidencias betweenentre theas twodúas genomesecuencias sequencesxenómicas.
 
== Notas ==