Ficoeritrina: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Notas |
|||
Liña 32:
As ficoeritrinas agás a ficoeritrina 545 (PE545) están compostas por monómeros (αβ) ensamblados en hexámeros con forma de disco (αβ)<sub>6</sub> ou trímeros (αβ)<sub>3</sub> con simetría 32 ou 3, que encerran un canal central. Nos [[ficobilisoma]]s (PBS) cada trímero ou hexámero contén como mínimo unha proteína de enlace localizada no canal central. A B-ficoeritrina (B-PE) e a R-ficoeritrina (R-PE) das [[alga vermella|algas vermellas]] ademais das cadeas α e β teñen unha terceira cadea chamada subunidade γ que é unha cadea que combina as funcións de enlace e de captación de luz, xa que leva cromóforos. <ref name=Ficner93/>
[[Ficheiro:B-phycoerythrin 3V57.gif|miniatura|none|580px|Estrutura cristalina da B-ficoeritrina da alga vermella ''[[Porphyridium cruentum]]'' ({{PDB|3V57}} <ref name = CamaraArtigas12/><ref name="RasTop" />). A unidade asimétrica ({{color|green|α}}{{color|blue|β}})<sub>2</sub> á esquerda e a molécula biolóxica asumida ({{color|green|α}}{{color|blue|β}})<sub>3</sub>. Contén {{color|#FF40FF|ficoeritrobilina}}, {{color|#FF6600|N-metil asparaxina}} e {{color|#FFD500|SO<sub>4</sub><sup>2-</sup>}}.]]
A R-ficoeritrina (R-PE) é producida predominantemente polas algas vermellas. A proteína consta polo menos de tres subunidades diferentes e varía segundo a especie. A estrutura da subunidade da R-ficoeritrina máis común é (αβ)<sub>6</sub>γ. A subunidade α ten dúas ficoeritrobilinas (PEB), a subunidade β ten 2 ou 3 [[ficoeritrobilina]]s e unha [[ficourobilina]] (PUB), mentres que as subunidades gamma teñen 3 ficoeritrobilinas e dúas ficourobilinas (γ<sub>1</sub>) ou 1 ou 2 ficoeritrobilinas e 1 ficourobilina (γ<sub>2</sub>). O peso molecular da R-ficoeritrina é de 250.000 [[Dalton (unidade)|Da]].
Liña 72:
|}
[[Ficheiro:Phycoerythrin 545 1XG0.gif|miniatura|400px|Estrutura cristalina da ficoeritrina 545 (PE545) da [[Cryptomonada|criptófita]] unicelular ''[[Rhodomonas]]'' CS24 ({{PDB|1XG0}} <ref name=Doust04/><ref name="RasTop" />). Cores: cadeas - {{color|#80FF00|alfa-2}}, {{color|#00BF00|alfa-3}}, {{color|#0080FF|beta}}, {{color|#5B5BFF|beta}} ([[hélice alfa|hélices]], [[folla beta|follas]] en amarelo), {{color|#FF40FF|ficoeritrobilina}}, {{color|#BF00BF|15,16-dihidrobiliverdina}} (15,16-DHBV), {{color|#800000|5-hidroxilisina}}, {{color|#FF6600|N-methyl asparaxina}}, {{color|red|Mg<sup>2+</sup>}}, {{color|#FFD500|Cl<sup>-</sup>}}.]]
A molécula biolóxica asumida de ficoeritrina 545 (PE545) é (αβ)<sub>2</sub> ou máis ben {{nowrap|(α<sub>3</sub>β)(α<sub>2</sub>β)}}. Os números 3 e 2 despois de α na segunda fórmula son parte dos nomes da cadea aquí, non as súas cantidades. O nome sinónimo nas criptófitas da cadea α<sub>3</sub> é cadea α<sub>1</sub>.
Liña 85:
Debaixo a estrutura cristalina da R-ficoeritrina de [[Protein Data Bank]]:
[[Ficheiro:R-phycoerythrin 1EYX 1 of 2.gif|miniatura|none|580px|Estrutura cristalina da R-ficoeritrina da alga vermella ''[[Gracilaria|Gracilaria chilensis]]'' {{PDB|1EYX}} <ref name=ContrerasMartel01/><ref name="RasTop" />. Oligómero básico ({{color|green|α}}{{color|blue|β}}{{color|red|γ}})<sub>2</sub> (denominada unidade asimétrica). Contén {{color|#BF00BF|ficocianobilina}}, {{color|#FF40FF|biliverdina IX alfa}}, {{color|#FF80FF|ficourobilina}}, {{color|#FF6600|N-metil asparaxina}}, {{color|#FFD500|SO<sub>4</sub><sup>2-</sup>}}. Un fragmento da cadea γ en vermello, o segundo branco porque non se considera [[hélice alfa]] a pesar da súa secuencia de aminoácidos idéntica.]]
[[Ficheiro:R-phycoerythrin 1EYX 2 of 2.gif|miniatura|none|580px|O oligómero enteiro de R-ficoeritrina de ''[[Gracilaria|Gracilaria chilensis]]'' ({{color|green|α}}{{color|blue|β}}{{color|red|γ}})<sub>6</sub> {{PDB|1EYX}} <ref name=ContrerasMartel01/><ref name="RasTop" />.]]
==Características espectrais==
Liña 144:
<ref name=PDBwww>{{cite web |url=http://www.rcsb.org/pdb/ |title=Protein Data Bank |publisher=RCSB Protein Data Bank (PDB) |accessdate=12 October 2012}}</ref>
<ref name="RasTop">Image created with [http://www.geneinfinity.org/rastop/ RasTop] (Molecular Visualization Software).</ref>
<ref name=Glazer85>{{cite journal |authors=Glazer A. N. |year=1985 |title=Light Harvesting by Phycobilisomes. |journal=Annual Review of Biophysics and Biophysical Chemistry |volume=14 |pages=47–77 |pmid=3924069 |doi=10.1146/annurev.bb.14.060185.000403 |url=http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev.bb.14.060185.000403 |accessdate=13 October 2012}}</ref>
| |||