O uso de augas residuais non tratadas para o rego agrícola supón un perigo sanitario significativo. As augas residuais das cidades poden conter unha mestura de contaminantes químicos e biolóxicos. Nos países pobres, hai un alto nivel de patóxenos nos excrementos, e nas nacións con economías emerxentes o desenvolvemento industrial vai mnáis rápido que as regulacións legais, polo que aumenta o risco de que as augas leven compostos químicos orgánicos e inorgánicos de procedencia industrial. A [[Organización Mundial da Saúde]] (OMS), en colaboración coa [[Organización para a Agricultura e a Alimentación]] (FAO) das [[Nacións Unidas]] e o Programa Medioambiental das Nacións Unidas (PMANU ou UNEP), elaborou unhas directrices xerais para o uso das augas residuais.
O ''[[Instituto da Xestión da Auga Internacional]] (''International Water Management Institute]]'') traballou en varios proxectos en India, Pakistan, Vietnam, Ghana, Etiopía, México e outros países encomiñados a avaliar e reducir assessingos andriscos reducingdo risksrego ofcon wastewateraugas irrigationresiduais. TheyAvoga advocatepor aunha ‘multiple-barrier’estratexia approachtode wastewater"barreiras usemúltiples" para o uso das augas residuais, whereno cal se anima aos agricultores a farmersadoptar arediversos encouragedcomportamenteo tos adoptque variousreducen risk-reducingos behavioursriscos. TheseEstes includeinclúen ceasingdeixar irrigationde aregar uns poucos días antes da recollida da fewcolleita dayspara beforepermitir harvestingque toos allowpatóxenos pathogensmorran topor dieexposición offá inluz thedo sunlightsol, applyingaplicar watero carefullyrego sona itbase doesda notplanta contaminatepara leavesque likelynon tocontamine beas follas se estas se van eatencomer rawcrúas, cleaninglimpar vegetablesos withvexetais disinfectantcon ordesinfectante allowingou fecaldeixar sludgeque usedos inlodos farmingfecais tousados dryna beforeagricultura beingsequen usedantes asde autilizalos como humanesterco manurehumano.<ref>[http://www.iwmi.cgiar.org/Publications/Water_Issue_Briefs/index.aspx Wastewater use in agriculture: ''Not only an issue where water is scarce!''] [[International Water Management Institute]]'', 2010. Water Issue Brief 4</ref>
