Ficoeritrina: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 73:
 
[[Ficheiro:Phycoerythrin 545 1XG0.gif|miniatura|400px|Estrutura cristalina da ficoeritrina 545 (PE545) da [[Cryptomonada|criptófita]] unicelular ''[[Rhodomonas]]'' CS24 ({{PDB|1XG0}} <ref name=Doust04/>). Cores: cadeas - {{color|#80FF00|alfa-2}}, {{color|#00BF00|alfa-3}}, {{color|#0080FF|beta}}, {{color|#5B5BFF|beta}} ([[hélice alfa|hélices]], [[folla beta|follas]] en amarelo), {{color|#FF40FF|ficoeritrobilina}}, {{color|#BF00BF|15,16-dihidrobiliverdina}} (15,16-DHBV), {{color|#800000|5-hidroxilisina}}, {{color|#FF6600|N-methyl asparaxina}}, {{color|red|Mg<sup>2+</sup>}}, {{color|#FFD500|Cl<sup>-</sup>}}.]]
A molécula biolóxica asumida de fitoeritrinaficoeritrina 545 (PE545) é (&alpha;&beta;)<sub>2</sub> ou máis ben {{nowrap|(&alpha;<sub>3</sub>&beta;)(&alpha;<sub>2</sub>&beta;)}}. Os números 3 e 2 despois de &alpha; na segunda fórmula son parte dos nomes da cadea aquí, non as súas cantidades. O nome sinónimo nas criptófitas da cadea &alpha;<sub>3</sub> é cadea &alpha;<sub>1</sub>.
 
A ensamblaxe máis grande de B-fitoeritrinaficoeritrina (B-PE) é o trímero (&alpha;&beta;)<sub>3</sub> {{PDB|3V57}}<ref name=CamaraArtigas12/>, pero en preparacións de algas vermellas obtívose tamén o hexámero (&alpha;&beta;)<sub>6</sub> <ref name=Ficner93/>. No caso da R-fitoeritrinaficoeritrina (R-PE) a molécula máis grande asumida aquí é (&alpha;&beta;&gamma;)<sub>6</sub>, {{nowrap|(&alpha;&beta;&gamma;)<sub>3</sub>(&alpha;&beta;)<sub>3</sub>}} ou (&alpha;&beta;)<sub>6</sub> dependendo da publicación, para outros tipos de fitoeritrinaficoeritrina (&alpha;&beta;)<sub>6</sub>. Estas cadeas &gamma; de Protein Data Bank son moi pequenas e constan só de 6 ou 3 aminoácidos recoñecibles ({{PDB|1EYX}})<ref name=ContrerasMartel01/>, mentres que a cadea de enlace &gamma; descrita ao inicio desta sección é grande (por exemplo de 277 aminoácidos e 33 [[dalton (unidade)|kDa]] no caso da &gamma;<sup>33</sup> da alga vermella ''[[Aglaothamnion neglectum]]'') <ref name=Apt93/> <ref name=Ficner93/>. Isto débese a que por problemas cristalográficos só poden modelarse uns poucos aminoácidos ({{PDB|1EYX}} <ref name=ContrerasMartel01/> {{PDB|1B8D}} <ref name=Ritter99/>).
 
Para (&alpha;&beta;&gamma;)<sub>6</sub>, (&alpha;&beta;)<sub>6</sub> ou {{nowrap|(&alpha;&beta;&gamma;)<sub>3</sub>(&alpha;&beta;)<sub>3</sub>}} os valores da táboa deberían simplemente multiplicarse por 3, (&alpha;&beta;)<sub>3</sub> contén números intermedios de moléculas non proteicas.