Ficoeritrina: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Liña 35:
[[Ficheiro:B-phycoerythrin 3V57.gif|miniatura|none|580px|Estrutura cristalina da B-ficoeritrina da alga vermella ''[[Porphyridium cruentum]]'' ({{PDB|3V57}} <ref name = CamaraArtigas12/>). A unidade asimétrica ({{color|green|α}}{{color|blue|β}})<sub>2</sub> á esquerda e a molécula biolóxica asumida ({{color|green|α}}{{color|blue|β}})<sub>3</sub>. Contén {{color|#FF40FF|ficoeritrobilina}}, {{color|#FF6600|N-metil asparaxina}} e {{color|#FFD500|SO<sub>4</sub><sup>2-</sup>}}.]]
A R-ficoeritrina (R-PE) é producida predominantemente polas algas vermellas. A proteína
As estruturas cristalinas dispoñibles no [[Protein Data Bank]] <ref name=PDBwww/> conteñen unha unidade asimétrica (αβ)<sub>2</sub> ou (αβγ)<sub>2</sub> de diferentes ficoeritrinas:
Liña 74:
[[Ficheiro:Phycoerythrin 545 1XG0.gif|miniatura|400px|Estrutura cristalina da ficoeritrina 545 (PE545) da [[Cryptomonada|criptófita]] unicelular ''[[Rhodomonas]]'' CS24 ([[Protein Data Bank|PDB]] ID: 1XG0 {{PDB|1XG0}} <ref name=Doust04/>). Colors: chains - {{color|#80FF00|alfa-2}}, {{color|#00BF00|alfa-3}}, {{color|#0080FF|beta}}, {{color|#5B5BFF|beta}} ([[hélice alfa|hélices]], [[folla beta|follas]] en amarelo), {{color|#FF40FF|ficoeritrobilina}}, {{color|#BF00BF|15,16-dihidrobiliverdina}} (15,16-DHBV), {{color|#800000|5-hidroxilisina}}, {{color|#FF6600|N-methyl asparaxina}}, {{color|red|Mg<sup>2+</sup>}}, {{color|#FFD500|Cl<sup>-</sup>}}.]]
A molécula biolóxica
A ensamblaxe máis grande de B-fitoeritrina (B-PE) é o trímero (αβ)<sub>3</sub> {{PDB|3V57}}<ref name=CamaraArtigas12/>, pero en preparacións de algas vermellas obtívose tamén o hexámero (αβ)<sub>6</sub> <ref name=Ficner93/>. No caso da R-fitoeritrina (R-PE) a molécula máis grande asumida aquí é (αβγ)<sub>6</sub>, {{nowrap|(αβγ)<sub>3</sub>(αβ)<sub>3</sub>}} ou (αβ)<sub>6</sub> dependendo da publicación, para outros tipos de fitoeritrina (αβ)<sub>6</sub>. Estas cadeas γ de Protein Data Bank son moi pequenas e constan só de 6 ou 3 aminoácidos recoñecibles {{PDB|1EYX}}<ref name=ContrerasMartel01/>, mentres que a cadea deenlace γ descrita ao inicio desta sección é grande (por exemplo de 277 aminoácidos e 33 [[dalton (unidade)|kDa]] no caso da γ<sup>33</sup> da alga vermella ''[[Aglaothamnion neglectum]]'') <ref name=Apt93/> <ref name=Ficner93/>. Isto débese a que a densidade de electróns do polipéptido gamma é principalmente mediado por simetría cristalográfica triple e só poden modelarse uns poucos aminoácidos {{PDB|1EYX}} <ref name=ContrerasMartel01/> {{PDB|1B8D}} <ref name=Ritter99/>.
| |||