Aconitase: Diferenzas entre revisións
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Liña 47:
[[Ficheiro:Citrate Zoom Final.png|thumb|none|upright=1.5|O citrato e o ''cluster'' Fe-S no sitio activo da aconitase: representáronse con liñas descontinuas amarelas as interaccións entre o substrato e os residuos veciños.<ref name="pmid10631981">{{PDB|1C96}}; {{cite journal | author = Lloyd SJ, Lauble H, Prasad GS, Stout CD | title = The mechanism of aconitase: 1.8 A resolution crystal structure of the S642a:citrate complex | journal = Protein Sci. | volume = 8 | issue = 12 | pages = 2655–62 | year = 1999 | month = December | pmid = 10631981 | pmc = 2144235 | doi = 10.1110/ps.8.12.2655 | url = }}</ref>]]
A aconitase emprega un mecanismo de deshidratación-hidratación.<ref name = "Mechanism Source" /> Os residuos catalíticos implicados son a His-101 e a Ser-642.<ref name = "Mechanism Source">{{cite web | url = http://web.ku.edu/~crystal/taksnotes/Biol_638/notes/chp_16.pdf | title = Chapter 16: Citric Acid Cycle | author = Takusagawa F | authorlink = | coauthors = | date = | format = | work = Takusagawa’s Note | publisher = The University of Kansas | accessdate = 2011-07-10 }}</ref> A [[histidina|His]]-101 protona o grupo hidroxilo no C3 do citrato, permitindo que se libere en forma de auga, e, ao mesmo tempo, a [[
Debátese como se produce exactamente este xiro. Unha teoría é que, no [[paso limitante]] do mecanismo, o ''cis''-aconitato libérase do encima, despois volve a unirse no modo isocitrato par completar a reacción.<ref name= "Different modes" /> Este paso limitante asegura que no produto final se formará a correcta [[estereoquímica]], especificamente (2R,3S).<ref name = "Different modes"/><ref name = "Exact sterochem">{{cite web | url = http://metallo.scripps.edu/PROMISE/ACONITASE.html | title = Aconitase family | author = | date = 1999-02-02| work = The Prosthetic groups and Metal Ions in Protein Active Sites Database Version 2.0 | publisher = The University of Leeds | accessdate = 2011-07-10 | archiveurl= http://web.archive.org/web/20110608223412/http://metallo.scripps.edu/PROMISE/ACONITASE.html| archivedate= 8 June 2011 <!--DASHBot-->| deadurl= no}}</ref> Outra hipótese é que o ''cis''-aconitato permanece unido ao encima mentres se produce o xiro pasando do modo citrato ao modo isocitrato.<ref name="Mechanism Source"/>
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