Sexa cal sexa a ruta de apoptose, o resultado é o de activar unha serie de [[protease|proteasas]], chamadas [[caspase|Caspasascaspasas]] (cisteín-asparaxín-proteasa). As caspasas son xeradas en forma de pre-caspasa inactiva. Durante o proceso apoptótico son parcialmente fragmentadas e activadas. A súa función é a de activar as '''nucleasas''', outras proteasas, cuxa función é destruír o material xenómico, culminando o proceso.
