Bioinformática: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Recuperando 33 fontes e etiquetando 0 como mortas.) #IABot (v2.0.2
Liña 122:
 
=== Análise de mutacións no cancro ===
No [[cancro]], os xenomas das células afectadas son reordenados en complexas e aínda impredicibles maneiras. Realízanse esforzos masivos de secuenciación para identificar substitucións individuais de bases (ou [[Mutación puntual|mutacións puntuais de nucleótidos]]) aínda descoñecidos nunha variedade de xenes no cancro.<ref name="AACR">{{Cita web|url=http://www.aacr.org/home/public--media/for-the-media/fact-sheets/cancer-concepts/snps.aspx|título=Cancer Concepts: SNPs|dataacceso=3 de outubro de 2008|autor=American Association for Cancer Research|ano=2008|idioma=inglés|urlarquivo=https://web.archive.org/web/20080924131744/http://www.aacr.org/home/public--media/for-the-media/fact-sheets/cancer-concepts/snps.aspx|dataarquivo=24 de setembro de 2008|urlmorta=yes}}</ref> Os bioinformáticos seguen producindo sistemas automatizados para xestionar o importante volume de datos de secuencias obtido, e crean novos [[algoritmo]]s e software para compararen os resultados de secuenciación coa crecientecrecente colección de secuencias do [[xenoma humano]] e dos [[Polimorfismo xenético|polimorfismos]] da [[liña xerminal]]. Estanse a utilizar novas tecnoloxías de detección física, como as micromatrices de [[oligonucleótido]]s para identificar perdas e ganancias cromosómicas (técnica denominada [[hibridación xenómica comparativa]]),<ref name="Pinkel 2005">{{cita publicación periódica | autor = Pinkel, D.; Albertson, D. G.
| título = Array comparative genomic hybridization and its applications in cancer | ano = 2005 | revista = Nature Genetics | volume = 37 | id = Páxs. S11-S17 | url = http://www.nature.com/ng/journal/v37/n6s/pdf/ng1569.pdf}}</ref> e os arrays de [[Polimorfismo de nucleótido simple|polimorfismos de nucleótido simple]] para detectar ''puntos de mutación'' coñecidos.<ref name="Zhao 2004">{{cita publicación periódica| autor = Zhao, X., et al. | título = An Integrated View of Copy Number and Allelic Alterations in the Cancer Genome Using Single Nucleotide Polymorphism Arrays | ano = 2004 | revista = Cancer Research | volume = 64 | id = Páxs. 3060-3071 | url = http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/reprint/64/9/3060}}</ref> Estes métodos de detección miden simultaneamente bastantes centos de miles de posicións ao longo do xenoma, e cando se usan cunha alta produtividade para analizar miles de mostras, xeran [[terabyte]]s de datos en cada experimento. Deste xeito, as masivas cantidades e novos [[Tipo de dato|tipos de datos]] proporcionan novas oportunidades para os bioinformáticos. Con frecuencia encóntrase nos datos unha considerable variabilidade, ou [[Ruído (comunicación)|ruído]], polo que están en desenvolvemento métodos como o dos [[Modelo oculto de Markov|modelos ocultos de Markov]] e a análise de [[puntos de cambio]] para inferir cambios reais no número de copias dos xenes (número de copias dun xene particular no [[xenotipo]] dun individuo, cuxa magnitude pode ser elevada en células canceríxenas).<ref name="Lai 2005">{{cita publicación periódica | autor = Lai, W. R., et al. | título = Comparative analysis of algorithms for identifying amplifications and deletions in array CGH data | ano = 2005 | revista = Bioinformatics | volume = 21 | número = 19 | id = ISSN 1460-2059, Páxs. 3763-3770 | url = http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/21/19/3763}}</ref><ref name="Olshen 2002">{{cita publicación periódica | autor = Olshen, A. B.; Venkatraman, E. S. | título = Change-point analysis of array-based comparative genomic hybridization data | ano = 2002 | revista = American Statistical Association Proceedings of the Joint Statistical Meetings, American Statistical Association, Alexandria, VA | id = Páxs. 2530-2535}}</ref>