Termodinámica dos ácidos nucleicos: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Recuperando 4 fontes e etiquetando 0 como mortas.) #IABot (v2.0
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 25:
En xenética, ''annealing'' (traducido ás veces por anelamento, temperado, aliñamento, hibridación) significa o apareamento por formación de [[ponte de hidróxeno|pontes de hidróxeno]] para formar unha dobre hélice entre dúas cadeas complementarias de ácidos nucleicos, [[ADN]] ou [[ARN]]. O termo utilízase moitas veces para describir a unión a unha febra de ADN por apareamento de bases dunha [[sonda de ADN]] ou dun [[cebador]] ou ''primer'' durante a [[reacción en cadea da polimerase]]. O termo tamén se usa para describir a re-formación (''reannealing'') da dobre hélice a partir de ADN que foi previamente desnaturalizado termicamente e separado en febras complementarias. Proteínas como [[RAD52]] axudan ao ''annealing'' do ADN.
 
== TermodinamicaTermodinámica do modelo de dous estados e cálculo de T<sub>m</sub> ==
Utilízanse varias fórmulas para calcular os valores de ''T<sub>m</sub>''.<ref>{{Cita publicación periódica| author=Breslauer, K.J. et al.|year=1986| journal=Proc. Natl. Acad. Sci. USA.| title=Predicting DNA Duplex Stability from the Base Sequence| pmid=3459152|volume=83| issue=11| pmc=323600| pages=3746–3750| doi=10.1073/pnas.83.11.3746| last2=Frank| first2=R| last3=Blöcker| first3=H| last4=Marky|url=http://www.pnas.org/content/83/11/3746 }}</ref><ref>{{Cita publicación periódica| doi=10.1093/nar/18.21.6409| author=Rychlik, W.; Spencer, W. J.; Rhoads, R. E. | year=1990 |title=Optimization of the annealing temperature for DNA amplification in vitro | journal=Nucleic Acids Res. |volume=18 |pages=6409–6412 |issue=21 |pmid=2243783 |pmc=332522}}</ref> Algunhas fórmulas son máis axeitadas para predicir as temperaturas de fusión de dúplex de ADN.<ref>{{Cita publicación periódica| author=Owczarzy R., Vallone P.M., Gallo F.J., Paner T.M., Lane M.J. and Benight A.S | year=1997 |title=Predicting sequence-dependent melting stability of short duplex DNA oligomers | journal=Biopolymers| pmid=9591477 |volume=44| issue=3|pages=217–239 |doi=10.1002/(SICI)1097-0282(1997)44:3<217::AID-BIP3>3.0.CO;2-Y|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/%28SICI%291097-0282%281997%2944%3A3%3C217%3A%3AAID-BIP3%3E3.0.CO%3B2-Y}}</ref> Para oligonucleótidos de ADN, é dicir, curtas secuencias de ADN, a termodinámica da hibridación pode ser adecuadamente descrita como un proceso de dous estados. Nesta aproximación non se ten en conta a posibilidade de que existan estados intermedios de unión parcial na formación do estado de dobre hélice a partir de oligonucleótidos dunha soa febra. Asumindo isto, poden describirse elegantemente os parámetros termodinámicos da formación de ácidos nucleicos bicatenarios AB a partir de ácidos nucleicos monocatenarios A e B.