Secuenciación de escopeta: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Liña 193:
== Secuenciación de escopeta metaxenómica ==
 
Para determinar a especie/cepa do organismo do cal procede o ADN examinado, é dabondo ter lecturas de 400-500 pares de bases con tal que o seu xenoma sexa xa coñecido, usando por exemplo un software de clasificación taxonómica [[K-mer|baseado en k-mer]]. Con millóns de lecturas de secuenciación de seguinte xeración de mostras ambientais, é posible ter unha visión completa de calquera [[microbioma]] complexo formado por miles de especies, como a [[flora intestinal]]. As vantaxes sobre a [[secuenciación de amplicón]] de [[ARNr 16S]] son: non está limitada a bacterias; pode facer unha clasificación ao nivel de cepas, mentres que a secuenciación de [[amplicón]] só o fai a nivel de xénero; e a posibilidade de extraer [[xene]]s completos e especificar as súas funcións como parte do [[metaxenómica|metaxenoma]].<ref>{{Cita publicación periódica
| last1 = Roumpeka
| first1 = Despoina D.