Sitio CpG: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 41:
:<math>((\text{número de }C + \text{número de }G)/2)^2 / \text{lonxitude da secuencia}</math><ref name="Saxonov2006"/>
 
Moitos xenes nos xenomas de mamíferos teñen illas CpG asociadas co comezo dun xene<ref>{{cite book |title=Genetics: Analysis of Genes and Genomes |vauthors=Hartl DL, Jones EW |page=477 |edition=6th |year=2005 |publisher=Jones & Bartlett, Canada |location=Missisauga |isbn=978-0-7637-1511-3}}</ref> (as [[Promotor (xenética)|rexións promotoras]]). Debido a isto, a presenzpresenza dunha illa CpG utilízseutilízase para axudar á predición e anotación de xenes.
 
Nos xenomas de mamíferos, as illas CpG son normalmente de entre 300 e 3&nbsp;000 pares de bases de lonxitude, e atopáronse en aproximadamente o 40% dos [[promotor (xenética)|promotores]] dos xenes de mamíferos.<ref name="Fatemi2005">{{cite journal |vauthors=Fatemi M, Pao MM, Jeong S, Gal-Yam EN, Egger G, Weisenberger DJ, Jones PA |title=Footprinting of mammalian promoters: use of a CpG DNA methyltransferase revealing nucleosome positions at a single molecule level |journal=Nucleic Acids Res |volume=33 |issue=20 |pages=e176 |year=2005 |pmid=16314307 |pmc=1292996 |doi=10.1093/nar/gni180}}</ref> Un 70% dos promotores humanos teñen unha alta concentración de CpG. Dada a frecuencia de secuencias de dous nucleótidos GC, o número de dinucleótidos CpG é moito menor do esperado.<ref name="Saxonov2006">{{cite journal |vauthors=Saxonov S, Berg P, Brutlag DL |title=A genome-wide analysis of CpG dinucleotides in the human genome distinguishes two distinct classes of promoters |journal=Proc Natl Acad Sci USA |volume=103 |issue=5 |pages=1412–1417 |year=2006 |pmid=16432200 |pmc=1345710 |doi=10.1073/pnas.0510310103}}</ref>