Sitio CpG: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 90:
 
== Os sitios CpG e a memoria ==
[[Ficheiro:Initiation of DNA demethylation at a CpG site.svg|miniatura|Iniciación da [[desmetilación do ADN]] nun sitio CpG. En células somáticas adultas a metilación do ADN ocorre tipicamente no contexto de dinucleótidos CpG (sitios CpG), formando [[5-metilcitosina]]-pG ou 5mCpG. As [[especie reactiva do oxíxeno|especies reactivas do oxíxeno]] poden atacar a guanina no sitio do dinucleótido, formando [[8-oxo-2'-desoxiguanosina|8-hidroxi-2'-desoxiguanosina]] (8-OHdG), orixinando nun sitio dinucleótido 5mCp-8-OHdG. O encima de [[reparación por escisión de bases]] [[oxoguanina glicosilase|OGG1]] ten como diana a 8-OHdG e únese á lesión sen escisión inmediata. A OGG1, presente no sitio 5mCp-8-OHdG recruta a [[Tet metilcitosina dioxixenase 1|TET1]] e TET1 oxida a 5mC adxacente á 8-OHdG. Isto inicia a desmetilación de 5mC.<ref name=Zhou>{{cite journal |vauthors=Zhou X, Zhuang Z, Wang W, He L, Wu H, Cao Y, Pan F, Zhao J, Hu Z, Sekhar C, Guo Z |title=OGG1 is essential in oxidative stress induced DNA demethylation |journal=Cell. Signal. |volume=28 |issue=9 |pages=1163–71 |date=September 2016 |pmid=27251462 |doi=10.1016/j.cellsig.2016.05.021 |url=}}</ref>]]
 
[[Ficheiro:Demethylation of 5-methylcytosine.svg|miniatura|Desmetilación de [[5-metilcitosina]] (5mC) en ADN de neuronas. Como se revisou en 2018,<ref name="pmid29875631">{{cite journal |vauthors=Bayraktar G, Kreutz MR |title=The Role of Activity-Dependent DNA Demethylation in the Adult Brain and in Neurological Disorders |journal=Front Mol Neurosci |volume=11 |issue= |pages=169 |date=2018 |pmid=29875631 |pmc=5975432 |doi=10.3389/fnmol.2018.00169 |url=}}</ref> en neuronas do cerebro, a 5mC é oxidado pola familia da translocación dez-once (TET) de dioxixenases ([[TET1]], [[TET2]], [[TET3]]) para xerar [[5-hidroximetilcitosina]] (5hmC). En pasos sucesivos os enzimas TET seguen hidolizando a 5hmC para xerar 5-formilcitosina (5fC) e 5-carboxilcitosina (5caC). A [[timina-ADN glicosilase]] (TDG) recoñece as bases intermedias 5fC e 5caC e escinde o [[enlace glicosídico]] resultante nun sitio apirimidínico ([[sitio AP]]). Nunha vía de [[desaminación oxidativa]] alternativa, a 5hmC pode ser desamimnada oxidativamente polas desaminases [[APOBEC3G|(AID/APOBEC)]] para formar 5-hidroximetiluracilo (5hmU) ou 5mC pode ser convertido en [[timina]] (Thy). O 5hmU pode ser clivado pola TDG, a [[SMUG1]], a [[NEIL1]], ou a [[MBD4]]. Os [[sitio AP|sitios AP]] e as discordancias T:G son despois reparadas por enzimas da [[reparación por escisión de bases]] (BER) para render [[citosina]] (Cyt).]]
En mamíferos, as [[ADN metiltransferase]]s (que engaden [[grupo metilo|grupos metilo]] a bases do ADN) mostran unha preferencia de secuencia polas citosinas que están nos sitios CpG.<ref name=Ziller>{{cite journal |vauthors=Ziller MJ, Müller F, Liao J, Zhang Y, Gu H, Bock C, Boyle P, Epstein CB, Bernstein BE, Lengauer T, Gnirke A, Meissner A |title=Genomic distribution and inter-sample variation of non-CpG methylation across human cell types |journal=PLoS Genet. |volume=7 |issue=12 |pages=e1002389 |date=December 2011 |pmid=22174693 |pmc=3234221 |doi=10.1371/journal.pgen.1002389 |url=}}</ref> No cerebro de rato o 4,2% de todas as citosinas están metiladas, principalmente no contexto dos sitios CpG, formando 5mCpG.<ref name=Fasolino>{{cite journal |vauthors=Fasolino M, Zhou Z |title=The Crucial Role of DNA Methylation and MeCP2 in Neuronal Function |journal=Genes (Basel) |volume=8 |issue=5 |pages= 141|date=May 2017 |pmid=28505093 |pmc=5448015 |doi=10.3390/genes8050141 |url=}}</ref> A maioría dos sitios 5mCpG hipermetilados incrementan a represión de xenes asociados.<ref name=Fasolino />