Revisión como estaba o 12 de febreiro de 2019 ás 21:41 editar Miguelferig (conversa \| contribucións) 242.147 edicións →‎Secuenciación de escopeta xerárquica ← Edición máis vella		Revisión como estaba o 12 de febreiro de 2019 ás 21:52 editar desfacer Miguelferig (conversa \| contribucións) 242.147 edicións →‎Secuenciación de escopeta xerárquica Edición máis nova →
Liña 152: Aínda que as secuencias completas de cóntigos de BACs non se coñecen, as súas orientacións relativas entre eles si se saben. Hai varios métodos para deducir esta orde e seleccionando os BACs que constitúen o camiño de baldosas. A estratexia xeral supón identificar as posicións de clons unha en relación doutra e despois seleccionando o menor número de clons necesarios para formar un armazón contiguo que cubra toda a área de interese. A orde dos clons dedúcese determinando o modo no cal se solapan.<ref name="genome map">Dear, P. H. ''Genome Mapping''. Encyclopedia of Life Sciences, 2005. {{doi\|10.1038/npg.els.0005353}}.</ref> Os clons que se solapan poden ser identificados de varias maneiras. Unha pequena sonda etiquetada radioactivamente ou quimicamente que contén un [[sitio etiquetado por secuencia]] (STS ou ''sequence-tagged site'') poden hibridarse nunha micromatriz sobre o cal se imprimen os clons.<ref name="genome map" /> Deste modo, identifícanse todos os clons que conteñen un secuencia determinada no xenoma. O extremo dun destes clons pode despois ser secuenciado para render unha nova sonda e o proceso repetido nun método chamado [[chromosome walking]]. <!--▼ Alternatively, the BAC [[BAC library#Genomic libraries\|library]] can be restriction-digested. Two clones that have several fragment sizes in common are inferred to overlap because they contain multiple similarly spaced restriction sites in common.<ref name="genome map" /> This method of genomic mapping is called restriction fingerprinting because it identifies a set of restriction sites contained in each clone. Once the overlap between the clones has been found and their order relative to the genome known, a scaffold of a minimal subset of these contigs that covers the entire genome is shotgun-sequenced.<ref name="textbook" /> Alternativamente, a [[biblioteca de BACs]] pode ser dixerido por [[encima de restrición\|restrición]]. Dous clons que teñen varios tamaños de fragmentos en común infírese que se solapan porque conteñen múltiples sitios de restrición espallados regularmente en común.<ref name="genome map" /> Este método de mapado xenómico denomínase pegada dactilar de restrición porque identifica un conxunto de sitios de restrición contidos en cada clon. Unha vez que se atopou o solapamento entre os clons e se coñece a súa orde relativa no xenoma, secuénciase polo mátodo da escopeta un armazón dun subconxunto mínimo destes cóntigos que cobre todo o xenoma.<ref name="textbook" /> ▲<!-- Because it involves first creating a low-resolution map of the genome, hierarchical shotgun sequencing is slower than whole-genome shotgun sequencing, but relies less heavily on computer algorithms than whole-genome shotgun sequencing. The process of extensive BAC library creation and tiling path selection, however, make hierarchical shotgun sequencing slow and labor-intensive. Now that the technology is available and the reliability of the data demonstrated,<ref name="venter" /> and the speed and cost efficiency of whole-genome shotgun sequencing has made it the primary method for genome sequencing. -->

Secuenciación de escopeta: Diferenzas entre revisións