Secuenciación de escopeta: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Liña 137:
=== Cobertura ===
A [[cobertura (xenética)|cobertura]] (profundidade de lectura ou profundidade) é o número medio delecturas que representan un determinado [[nucleótido]] na secuencias reconstruída. Pode calcularse a partir da lonxitude do xenoma orixinal (''G''), o número delecturas (''N''), e a lonxitude media das lecturas (''L'') como <math>N\times L/G</math>. Por exemplo, un xenoma hipotético de 2.000 pares de bases reconstruído a partir de 8 lecturas cunha lonxitude media de 500 nucleótidos terá unha redundancia de 2x.
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Sometimes a distinction is made between ''sequence coverage'' and ''physical coverage''. Sequence coverage is the average number of times a base is read (as described above). Physical coverage is the average number of times a base is read or spanned by mate paired reads.<ref name="MeyersonFig1">{{Cite journal | last1 = Meyerson | first1 = M. | last2 = Gabriel | first2 = S. | last3 = Getz | first3 = G. | doi = 10.1038/nrg2841 | title = Advances in understanding cancer genomes through second-generation sequencing | journal = Nature Reviews Genetics | volume = 11 | issue = 10 | pages = 685–696 | year = 2010 | pmid = 20847746| pmc = }}</ref>
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