Electroforese en xel bidimensional: Diferenzas entre revisións

Os retos aos que se enfronta a análise baseada en software son a presenza de manchas incompletamente separadas (solapantes), é dicir, menos definidas ou separadas, as manchas débiles/ruído (por exemplo, as "manchas fantasma"), as diferenzas á hora de "correr" diferentes xeles (por exemplo, a proteína migra a diferentes posicións en diferentes xeles), as manchas sen correspondencia/indetectadas, que conducen a [[valores perdidos]],<ref>{{cite journal |vauthors=Pedreschi R, Hertog ML, Carpentier SC, etal |title=Treatment of missing values for multivariate statistical analysis of gel-based proteomics data |journal=Proteomics |volume=8 |issue=7 |pages=1371–83 |date=April 2008 |pmid=18383008 |doi=10.1002/pmic.200700975 }}</ref><ref>[https://web.archive.org/web/20150312131240/http://www.totallab.com/products/samespots/support/faq/missing-values.aspx What are missing values, and why are they a problem?]</ref> as manchas sen correspondencia con outras, os erros na cuantificación (varias manchas distintas poden ser detectadas erradamente polo software como unha mancha única, ou ben partes dunha mancha poden ser excluídas da cuantificación), e as diferenzas en [[algoritmo]]s de software e, por tanto, nas tendencias de análise.

 

 

Para un resumo dos enfoques actuais da análise por software de imaxes de electroforese en xel bidimensional ver <ref>{{cite journal |vauthors=Berth M, Moser FM, Kolbe M, Bernhardt J |title=The state of the art in the analysis of two-dimensional gel electrophoresis images |journal=Appl. Microbiol. Biotechnol. |volume=76 |issue=6 |pages=1223–43 |date=October 2007 |pmid=17713763 |pmc=2279157 |doi=10.1007/s00253-007-1128-0 }}</ref> ou <ref>{{cite journal |vauthors=Bandow JE, Baker JD, Berth M, etal |title=Improved image analysis workflow for 2-D gels enables large-scale 2-D gel-based proteomics studies--COPD biomarker discovery study |journal=Proteomics |volume=8 |issue=15 |pages=3030–41 |date=August 2008 |pmid=18618493 |doi=10.1002/pmic.200701184 |url=http://www3.interscience.wiley.com/journal/120749796}}</ref>.