Os epítopos úsanse moito en [[proteómica]] e o estudo de [[produto xénico|produtos xénicos]]. Utilizando técnicas de [[ADN recombinante]] as secuencias xenéticas codificadas polos epítopos que son recoñecidas polos anticorpos comúns poden fusionarse co xene. Despois da [[síntresesíntese de proteínas]], a etiqueta de epítopo resultante permite que o anticorpo encontre a proteína ou outro produto xénico o que é unha útil ferramenta de laboratorio para a localización, purificación, e posterior caracterización molecular. Epítopos comunmente usados para este propósito son: [[Myc-tag]], [[HA-tag]], [[FLAG-tag]], [[GST-tag]], [[Polihistidina-tag|6xHis]]<ref>{{Cita libro |title= Molecular biomethods handbook|last= Walker|first= John|autor2= Ralph Rapley|year= 2008|publisher= Humana Press |isbn= 1-60327-374-3|page=467}}</ref> e OLLAS.<ref>{{Cita web|last=Novus|first=Biologicals|title=OLLAS Epitope Tag|url=http://www.novusbio.com/ollas|publisher=Novus Biologicals|accessdate=23 November 2011}}</ref> Os péptidos poden unirse tamén a proteínas que forman enlaces [[covalente]]s co péptido, o que permite a súa inmobilización irreversible.<ref>{{Cita publicación periódica |last1=Zakeri |first1=B. | doi= 10.1073/pnas.1115485109|title= Peptide tag forming a rapid covalent bond to a protein, through engineering a bacterial adhesin|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences |year=2012 |volume=109 |pages=E690–7 |issue=12 |pmid=22366317 |pmc=3311370}}</ref>
