Hibridación ADN-ADN: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
m Arranxos varios +cda
Recuperando 1 fontes e etiquetando 0 como mortas. #IABot (v2.0beta8)
Liña 19:
== Substitución pola secuenciación do xenoma ==
 
Os críticos deste método consideran que esta técnica é inadecuada para a comparación de especies estreitamente emparentadas, xa que calquera intento de medir as diferenzas entre secuencias [[ortólogo|ortólogas]] entre organismos queda impedida pola abrumadora hibridación de secuencias [[parálogo|parálogas]] no [[xenoma]] dun organismo.<ref>[{{Cita web |url=http://personal.uncc.edu/jmarks/DNAHYB/Dnahyb2.html |título=DNA hybridization in the apes – Technical issues] |data-acceso=14 de xullo de 2015 |urlarquivo=https://web.archive.org/web/20070509132131/http://personal.uncc.edu/jmarks/DNAHYB/Dnahyb2.html |dataarquivo=09 de maio de 2007 |urlmorta=si }}</ref> A [[secuenciación de ADN]] e a posterior comparación computacional das secuencias é agora o método xeralmente usado para determinar a distancia xenética entre especies, aínda que a técnica clásica aínda se usa en microbioloxía para axudar a identificar bacterias.<ref>{{Cita publicación periódica| title=Use of checkerboard DNA–DNA hybridization to study complex microbial ecosystems| author=S.S. Socransky, A.D. Haffajee, C. Smith, L. Martin, J.A. Haffajee, N.G. Uzel, J. M. Goodson| journal=Oral Microbiology and Immunology| year=2004| volume=19| issue=6| pages=352–362| doi=10.1111/j.1399-302x.2004.00168.x| pmid=15491460}}</ref>
 
A estratexia moderna é levar a cabo a hidridación ADN–ADN ''in silico'' (no computador) usando [[secuenciación de xenomas completos|xenomas secuenciados]] total ou parcialmente.<ref name="doi10.1186/1471-2105-14-60">{{Cita publicación periódica|authors = Meier-Kolthoff JP, Auch AF, Klenk HP, Goeker M|title=Genome sequence-based species delimitation with confidence intervals and improved distance functions|journal=BMC Bioinformatics|volume=14|pages=60|year=2013|doi=10.1186/1471-2105-14-60}}</ref> A ferramenta [http://ggdc.dsmz.de GGDC] desenvolvida por [[DSMZ]] é a ferramenta máis precisa coñecida para calcular valores análogos DDH.<ref name="doi10.1186/1471-2105-14-60" /> Entre outras melloras algorítmicas, resolve o problema das secuencias parálogas ao filtralas coidadosamente das coincidencias entre as dúas secuencias xenómicas.