Retron: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
m →‎top: Arranxos varios, replaced: {{cite journal → {{Cita publicación periódica (6)
Liña 3:
 
[[Ficheiro:Retron organization.png|miniatura|350px|O [[operón]] retron leva unha secuencia promotora P que controla a síntese dun transcrito de ARN que leva tres [[loci]]: ''msr'', ''msd'' e ''ret''. O produto do xene ''ret'', unha reversotranscritase, procesa a porción ''msd/msr'' do transcrito de ARN a msDNA.]]
Os elementos retron teñen uns 2 kb de longo. Conteñen un só [[operón]] que controla a síntese dun transcrito de ARN que leva tres [[loci]]: ''msr'', ''msd'' e ''ret'', que están implicados na síntese do msDNA. A porción de ADN do msDNA está codificada polo [[xene]] ''msd'', a porción de ARN está codificada polo xene ''msr'', mentres que o produto do xene ''ret'' é unha reversotranscritase similar ás reversotranscritases dos [[retrovirus]] e outros tipos de retroelementos.<ref name="pmid16093702">{{citeCita journalpublicación periódica |vauthors=Lampson BC, Inouye M, Inouye S |title=Retrons, msDNA, and the bacterial genome |journal=Cytogenet Genome Res |volume=110 |issue=1–4 |pages=491–9 |year=2005 |url=http://gcat.davidson.edu/sybr-u/Lampson_2005.pdf |pmid=16093702 |doi=10.1159/000084982}}</ref> Igual que outras reversotranscritases, o retron RT contén sete rexións de [[aminoácido]]s [[conservación (xenética)|conservados]] (cos números do 1 ao 7 na figura), incluíndo unha secuencia [[tirosina|tyr]]-[[alanina|ala]]-[[ácido aspártico|asp]]-[[ácido aspártico|asp]] (YADD) moi conservada asociada co núcleo catalítico. O produto do xene ''ret'' é responsable de procesar a porción ''msd/msr'' do transcrito de ARN en msDNA.
 
Durante moitos anos despois do seu descubrimento en [[virus]] animais, críase que a [[reversotranscritase]] estaba ausente nos [[procariota]]s. Actualmente, non obstante, os elementos que codifican RT, é dicir, [[retroelemento]]s, atopáronse nunha ampla variedade de [[bacterias]]. Os retrons foron a primeira familia de retroelementos descubertos en bacterias; as outras dúas familias de retroelentos bacterianos coñecidos son os [[intrón do grupo II|intróns do grupo II]] e os retroelementos xeradores de diversidade (DGR, do inglés ''diversity-generating retroelements'').<ref>
{{Cita publicación periódica
{{cite journal
|vauthors=Simon DM, Zimmerly S |title=A diversity of uncharacterized reverse transcriptases in bacteria
|journal=Nucleic Acids Res. |volume=36 |issue=22 |pages=7219–29 |year=2008
|url=http://nar.oxfordjournals.org/content/36/22/7219.short |doi=10.1093/nar/gkn867}}
</ref> Os intróns do grupo II son os retroelementos bacterianos mellor caracterizados e o único tipo coñecido que presenta mobilidade autónoma; constan dunha RT codificada nunha estrutura de ARN con [[splicing|autoempalme]] catalítica. A mobilidade do intrón de grupo II é mediada por unha [[ribonucleoproteína]] que comprende un lazo (''lariat'') intrón unido a dúas [[proteína]]s codificacas no intrón. A segunda familia de retroelementos bacterianos, os DGR, non son móbiles, pero funcionan diversificando as secuencias de ADN.<ref>
{{Cita publicación periódica
{{cite journal
|vauthors=Medhekar B, Mille JF |title=Diversity-Generating Retroelements
|journal=Current Opinion in Microbiology |volume=10 |issue=4 |pages=388–395 |year=2007
|doi=10.1016/j.mib.2007.06.004 |pmc=2703298 |pmid=17703991}}
</ref> Por exemplo, os DGR median o cambio entre as fases patóxenas e de vida libre da bacteria ''[[Bordetella]].''<ref>
{{Cita publicación periódica
{{cite journal
|vauthors=Liu M, Gingery M, Doulatov SR, Liu Y, Hodes A, Baker S, Davis P, Simmonds M, Churcher C, Mungall K, Quail MA, Preston A, Harvill ET, Maskell DJ, Eiserling FA, Parkhill J, Miller JF |title=Genomic and Genetic Analysis of Bordetella Bacteriophages Encoding Reverse Transcriptase-Mediated Tropism-Switching Cassettes
|journal=J. Bacteriol. |volume=186 |issue=5 |pages=1503–17 |year=2004
Liña 22:
</ref>
 
Como os retron non son móbiles, a súa aparición en diversas especies bacterianas non é un fenómeno de "[[ADN egoísta]]". Máis ben, os retrons deben darlle algunha vantaxe selectiva ao organismo hóspede, pero non se sabe cal pode ser esa vantaxe. E con excepción da produción de msDNA, non se asociou ningún [[fenotipo]] claro a eles. Malia o considerable número de investigacións realizadas, sábese pouco da función dos msDNA, a mobilidade dos elementos retron, ou os seus efectos na célula hóspede.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica | last = Ahmed | first = AM |author2=Shimamoto T | year = 2003 | title = msDNA-St85, a multicopy single-stranded DNA isolated from Salmonella enterica serovar Typhimurium LT2 with the genomic analysis of its retron | journal = FEMS Microbiol Lett | volume = 224 | pages = 291&ndash;297 | pmid = 12892895 | doi = 10.1016/S0378-1097(03)00450-6 | issue = 2}}</ref><ref>{{citeCita journalpublicación periódica | last = Lampson | first = BC |author2=Xu C |author3=Rice SA |author4=Inouye S | year = 2002 | title = A partial copy of msDNA from a new retron element is likely a retrotransposed DNA found in the myxobacterium Nannocystis exedens | journal = Gene | volume = 299 | pages = 251&ndash;261 | pmid = 12459273 | doi = 10.1016/S0378-1119(02)00977-0 | issue = 1–2}}</ref>
 
== Notas ==