Proteína quinase activada por mitóxeno: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 80:
Como é típico do grupo das quinases CMGC, o sitio catalítico das MAP quinases ten unha secuencia consenso moi pouco definida para os substratos. Igual que todas as moléculas relacionadas, só necesitan unha diana formada polos aminoácidos [[serina]] / [[treonina]] seguidos dun pequeno aminoácido, preferiblemente [[prolina]] ("quinases prolina-dirixidas"). Pero como os sitios SP/TP son extremadamente comúns en todas as proteínas, os mecanismos de recoñecemento de substrato adicionais evolucionaron para asegurar a fidelidade de sinalización.<ref name="pmid23047924"/> A diferenza das súas moléculas máis relacionadas, as [[quinase dependente de ciclina|quinases dependentes de ciclinas]] (CDKs), onde os substratos son recoñecidos pola subunidade de [[ciclina]], as MAPK asócianse cos seus substratos por medio das rexións de unión auxiliares nos seus dominios quinase. A máis importante desas rexións consta da fenda de atraque hidofóbica e a rexión CD cargada negativamente. Xuntas recoñecen os denominados atraques MAPK ou motivos D (tamén chamados motivos de interacción de quinase / KIM). Os motivos D consisten esencialmente nun ou dous aminoácidos cargados positivamente, seguidos por residuos hidrofóbicos alternantes (principalmente [[leucina]]s), situadas normalmente augas arriba do sitio de fosforilación a unha distancia de 10 a 50 aminoácidos.<ref name="pmid16364919">{{cite journal | vauthors = Reményi A, Good MC, Bhattacharyya RP, Lim WA | title = The role of docking interactions in mediating signaling input, output, and discrimination in the yeast MAPK network | journal = Molecular Cell | volume = 20 | issue = 6 | pages = 951–62 | date = Dec 2005 | pmid = 16364919 | doi = 10.1016/j.molcel.2005.10.030 }}</ref> Moitos dos substratos de MAPK coñecidos conteñen motivos D que non só poden unirse ás MAPK, senón que tamén proporcionan recoñecemento específico para certas MAPK. Un dato interesante é que os motivos D non están restrinxidos aos substratos: as MAP2 quinases tamén conteñen ditos motivos nas súas porcions N-terminais, que son totalmente necesarios para a interacción MAP2K-MAPK e a activación das MAPK.<ref name="pmid19196711">{{cite journal | vauthors = Bardwell AJ, Frankson E, Bardwell L | title = Selectivity of docking sites in MAPK kinases | journal = The Journal of Biological Chemistry | volume = 284 | issue = 19 | pages = 13165–73 | date = May 2009 | pmid = 19196711 | pmc = 2676048 | doi = 10.1074/jbc.M900080200 }}</ref> De maneira similar, as fosfatases das MAP quinases de especificidade dual e as fosfatases das MAP específicas de tirosina únense a MAP quinases polo mesmo sitio de atraque.<ref name="pmid22375047">{{cite journal | vauthors = Goldsmith EJ | title = Three-dimensional docking in the MAPK p38α | journal = Science Signaling | volume = 4 | issue = 204 | pages = pe47 | date = Dec 2011 | pmid = 22375047 | doi = 10.1126/scisignal.2002697 }}</ref><ref name="pmid15466470">{{cite journal | vauthors = Huang Z, Zhou B, Zhang ZY | title = Molecular determinants of substrate recognition in hematopoietic protein-tyrosine phosphatase | journal = The Journal of Biological Chemistry | volume = 279 | issue = 50 | pages = 52150–9 | date = Dec 2004 | pmid = 15466470 | doi = 10.1074/jbc.M407820200 }}</ref> Os motivos D poden encontrarse incluso en certos reguladores das vías MAPK e proteínas armazón (por exemplo nas proteínas JIP de mamíferos).
 
Existen outros sitios de unión ao substrato peor coñecidos. Un deses sitios (o sitio DEF) está formado polo bucle de activación (cando está na conformación activa) e a MAP quinase-específica inserida baixo el. Este sitio pode acomodar [[péptido]]s cunha secuencia consenso FxFP ([[fenilalanina]]-x-fenilalanina-prolina), normalmente situada augas abaixo do sitio de fosforilación.<ref name="pmid18482985">{{cite journal | vauthors = Sheridan DL, Kong Y, Parker SA, Dalby KN, Turk BE | title = Substrate discrimination among mitogen-activated protein kinases through distinct docking sequence motifs | journal = The Journal of Biological Chemistry | volume = 283 | issue = 28 | pages = 19511–20 | date = Jul 2008 | pmid = 18482985 | pmc = 2443660 | doi = 10.1074/jbc.M801074200 }}</ref> Nótese que dito sitio só pode encontrarse en proteínas que necesitan recoñecer selectivamente as MAP quinases activas, asípolo que se encóntranseencontran case exclusivamente en substratos. Diferentes motivos poden cooperar entre si, como ocorre na familia Elk de factores de transcrición, que posúen tanto o motivo D coma o FxFP. A presenza dun motivo FxFP na proteína armazón KSR1 tamén serve para facer dela un substrato de ERK1/2, proporcionando un mecanismo de retroalimentación negativa para establecer o nivel correcto de activación de ERK1/2.
 
== Proteínas armazón ==