Cóntigo: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 19:
 
=== Ocos entre cóntigos ===
A miúdo persisten ocos despois de facer unha construción de cóntigos de BACs inicial. Estes ocos aparecen se a biblioteca de BACs examinada ten unha baixa complexidade, o que significa que non contén un alto número de STSs ou [[sitio de restrición|sitios de restrición]], ou se certas rexións son menos estables en hóspedes de clonación e, por esa razón, fosen infrarrepresentadas na biblioteca.<ref name="contig assembly" /> Se permanecen os ocos entre cóntigos despois de realizado o mapado de puntos de referencia de STS e a pegada dactilar de restrición, pode utilizarse para pechar eses ocos a secuenciación de extremos de cóntigos. Esta estratexia de secuenciación de extremos crea esencialmente un novo STS co cal facer un exame dos outros cóntigos. Alternativamente, a secuencia final dun cóntigo pode utilizarse como [[cebador]] para o método do [[Primer walking]] ao longo do oco.<ref name="textbook" />
Gaps often remain after initial BAC contig construction. These gaps occur if the [[Bacterial Artificial Chromosome]] (BAC) library screened has low complexity, meaning it does not contain a high number of STS or restriction sites, or if certain regions were less stable in cloning hosts and thus underrepresented in the library.<ref name="contig assembly" /> If gaps between contigs remain after STS landmark mapping and restriction fingerprinting have been performed, the sequencing of contig ends can be used to close these gaps. This end-sequencing strategy essentially creates a novel STS with which to screen the other contigs. Alternatively, the end sequence of a contig can be used as a primer to [[Primer walking|primer walk]] across the gap.<ref name="textbook" />
 
== Notas ==