Helicase: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
m Bot: Substitución automática de texto (-Gram-positiva +grampositiva)
m Bot: Substitución automática de texto (-Gram-negativa +gramnegativa)
Liña 65:
As helicases clasifícanse en 6 grupos (superfamilias) baseándose nos motivos de secuencia que comparten.<ref name="Singleton">{{Cita publicación periódica |doi=10.1146/annurev.biochem.76.052305.115300 |author=Martin Singleton, Mark S. Dillingham, and Dale B. Wigley |title=Structure and mechanism of Helicases and Nucleic Acid Translocases |journal=The Annual Review of Biochemistry |volume=76 |pages=23–50 |year=2007 |pmid=17506634}}</ref> As helicases que non forman unha estrutura en anel clasifícanse nas superfamilias 1 e 2 e as que forman o anel forman parte das superfamilias 3 a 6.<ref name="Fairman">{{Cita publicación periódica |doi=10.1016/j.sbi.2010.03.011 |author=Margaret E. Fairman-Williams, Ulf-Peter Guenther and Echard Jankowsky |title=SF1 and SF2 helicases: family matters |journal=Current Opinion in Structural Biology |volume=20 |pages=313–324 |year=2010 |pmid=20456941 |issue=3 |pmc=2916977}}</ref> As helicases tamén se clasifican como α ou β dependendo de se funcionan con ADN monocatenario (α helicases) ou bicatenario (β helicases). Tamén se clasifican pola súa polaridade de translocación, de tal maneira que se a trnalocación ocorre en [[direccionalidade (bioloxía molecular)|dirección 3’-5’]] a helicase considérase de tipo A, e se esta ocorre en dirección 5’-3’ é de tipo B.<ref name="Singleton"/>
 
* '''Superfamilia 1 (SF1)''': Esta superfamilia pode subdividirse en helicases SF1A e SF1B.<ref name="Singleton"/> Neste grupo de helicases a polaridade de translocación pode ser 3’-5’ (subfamilia SF1A) ou 5’-3’(subfamilia SF1B).<ref name="Singleton"/><ref name="Stelter">{{Cita publicación periódica |author=Stelter M, Acajjaoui S, McSweeney S, Timmins J. |title=Structural and Mechanistic Insight into DNA Unwinding by Deinococcus radiodurans UvrD |journal=PLoS ONE. |volume=8 |issue=10 |pages=:e77364 |year=2013 |pmid=24143224 |pmc=3797037 |doi=10.1371/journal.pone.0077364}}</ref> As helicases máis coñecidas de tipo SF1A son Rep e [[endonuclease UvrABC|UvrD]] de bacterias [[Gram-negativagramnegativa]]s, e a helicase PcrA helicase de bacterias [[grampositiva]]s.<ref name="Singleton"/> As helicases máis coñecidas do grupo SF1B son as helicases RecD e Dda.<ref name="Singleton"/>
* '''Superfamilia 2 (SF2)''': Este é o grupo máis grande de helicases, implicadas en diversos procesos celulares.<ref name="Singleton"/><ref name="Umate">{{Cita publicación periódica |doi=10.4161/cib.4.1.13844 |author=Pavan Umate, Narendra Tuteja and Renu Tuteja |title=Genome-wide comprehensive análisis of human helicases |journal=Communicative & Integrative Biology |volume=4 |pages=118–137 |year=2011 |pmid=21509200 |issue=1 |pmc=3073292}}</ref> Caracterízanse pola presenza de nove motivos conservados: Q, I, Ia, Ib, II, III, IV, V e VI.<ref name="Umate"/> Este grupo está composto principalmente por ARN helicases de caixa DEAD.<ref name="Fairman"/> Algunhas outras helicases incluídas en SF2 son as da familia de helicases de tipo RecQ e as de encmas de tipo Snf2.<ref name="Singleton"/> A maioría das helicases SF2 son de tipo A con poucas excepcións, como a familia XPD.<ref name="Singleton"/>
* '''Superfamilia 3 (SF3)''': Consta de helicases codificadas principalmente por pequenos [[virus de ADN]] e algúns [[NCLDV|virus de ADN grande nucleocitoplasmáticos]].<ref name="PUB00033628">{{Cita publicación periódica |author=Koonin EV, Aravind L, Iyer LM |title=Common origin of four diverse families of large eukaryotic DNA viruses |journal=J. Virol. |volume=75 |issue=23 |pages=11720–34 |year=2001 |pmid=11689653 |pmc=114758 |doi=10.1128/JVI.75.23.11720-11734.2001}}</ref><ref name="PUB00014778">{{Cita publicación periódica |author=Koonin EV, Aravind L, Leipe DD, Iyer LM |title=Evolutionary history and higher order classification of AAA+ ATPases |journal=J. Struct. Biol. |volume=146 |issue=1–2 |pages=11–31 |year=2004 |pmid=15037234 |doi=10.1016/j.jsb.2003.10.010}}</ref> Teñen unha direccionalidade de translocación 3’-5’, o que significa que son helicases de tipo A.<ref name="Singleton"/> A helicase SF3 máis coñecida é a helicase E1 do virus do papiloma.<ref name="Singleton"/>