Superfamilia de proteínas: Diferenzas entre revisións

 

* '''[[Clan PA]]'''. Os seus membros comparten un pregamento de [[barril beta]] dobre de tipo [[quimotripsina]] e mecanismos de [[proteólise]] similares, pero a identidade de secuencia é <10%. O clan contén tanto [[cisteína protease]]s coma [[serin protease]]s (diferentes [[nucleófilo]]s).<ref name=merops/><ref>{{cite journal|last=Bazan|first=JF|author2=Fletterick, RJ |title=Viral cysteine proteases are homologous to the trypsin-like family of serine proteases: structural and functional implications.|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|date=November 1988|volume=85|issue=21|pages=7872–6|pmid=3186696|doi=10.1073/pnas.85.21.7872|pmc=282299}}</ref>

* '''[[alfa/beta hidrolase|Superfamilia da α/β hidrolase]]'''. Os seus membros comparten unha folla α/β, que contén 8 [[febra beta|febras]] conectadas por [[hélice alfa|hélices alfa]] con residuos de [[tríada catalítica|tríade catalítica]] situados na mesma orde;<ref>{{cite journal |author=Carr PD, Ollis DL |title=Alpha/beta hydrolase fold: an update |journal=Protein Pept. Lett. |volume=16 |issue=10 |pages=1137–48 |year=2009 |pmid=19508187 |doi= |url=}}</ref> as súas actividades inclúen as de [[protease]]s, [[lipase]]s, [[peroxidase]]s, [[esterase]]s, [[epóxido hidrolase]]s e [[deshaloxenase]]s.<ref name="pmid10607665">{{cite journal |author=Nardini M, Dijkstra BW |title=Alpha/beta hydrolase fold enzymes: the family keeps growing |journal=Curr. Opin. Struct. Biol. |volume=9 |issue=6 |pages=732–7 |date=December 1999 |pmid=10607665 |doi= 10.1016/S0959-440X(99)00037-8|url=}}</ref>

* '''[[Barril TIM|Superfamilia de barril TIM]]'''. Os seus membros comparten unha gran estrutura de barril α₈β₈. É un dos pregamentos proteicos máis comúns, pero a [[monofilia]] desta familia aínda se discute.<ref>{{cite journal|last=Nagano|first=N|author2=Orengo, CA |author3=Thornton, JM |title=One fold with many functions: the evolutionary relationships between TIM barrel families based on their sequences, structures and functions.|journal=Journal of Molecular Biology|date=Aug 30, 2002|volume=321|issue=5|pages=741–65|pmid=12206759|doi=10.1016/s0022-2836(02)00649-6}}</ref><ref>{{cite journal|last=Farber|first=G|title=An α/β-barrel full of evolutionary trouble|journal=Current Opinion in Structural Biology|year=1993|volume=3|issue=3|pages=409–412|url=http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0959440X05801149|doi=10.1016/S0959-440X(05)80114-9}}</ref>

* '''[[Fosfatase alcalina|Superfamilia da fosfatase alcalina]]'''. Os seus membros comparten unha estrutura en sandwich αβα<ref>{{cite web|title=SCOP|url=http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/data/scop.b.d.bah.A.html|accessdate=28 May 2014}}</ref> e tamén levan a cabo [[promiscuidade encimática|reaccións promiscuas]] comúns por un mecanismo similar.<ref>{{cite journal|last=Mohamed|first=MF|author2=Hollfelder, F |title=Efficient, crosswise catalytic promiscuity among enzymes that catalyze phosphoryl transfer.|journal=Biochimica et Biophysica Acta|date=Jan 2013|volume=1834|issue=1|pages=417–24|pmid=22885024|doi=10.1016/j.bbapap.2012.07.015}}</ref>

* '''[[Superfamilia das inmunoglobulinas]]'''. Os seus membros comparten unha estrutura de tipo sandwich formada por díuas [[folla beta|follas de febras beta]] [[antiparalelismo (bioquímica)|antiparalelas]] ([[pregamento de inmunoglobulina|pregamento Ig]]), e están implicados no recoñecemento, unión, e [[adhesión celular|adhesión]].<ref name="pmid7932691">{{cite journal | author = Bork P, Holm L, Sander C | title = The immunoglobulin fold. Structural classification, sequence patterns and common core | journal = J. Mol. Biol. | volume = 242 | issue = 4 | pages = 309–20 |date=September 1994 | pmid = 7932691 | doi = 10.1006/jmbi.1994.1582 | url = | issn = }}</ref><ref name="pmid8574878">{{cite journal | author = Brümmendorf T, Rathjen FG | title = Cell adhesion molecules 1: immunoglobulin superfamily | journal = Protein Profile | volume = 2 | issue = 9 | pages = 963–1108 | year = 1995 | pmid = 8574878 | doi = | url = | issn = }}</ref>

* '''[[Globina|Superfamilia das globinas]]'''. Os seus membros comparten un [[pregamento de globina]] globular de 8 hélices.<ref>{{cite book|last1=Branden|first1=Carl|last2=Tooze|first2=John|title=Introduction to protein structure|date=1999|publisher=Garland Pub.|location=New York|isbn=978-0815323051|edition=2nd}}</ref><ref>{{Cite journal

| pmid = 2926816

*[[Homoloxía (bioloxía)]]

*[[SUPERFAMILY (base de datos)|SUPERFAMILY]]

 

[[Categoría:Evolución]]