Indel: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Liña 118:
| doi = 10.1016/S1383-5718(02)00277-2
}}</ref> Unha TBM defínese como unha substitución en nucleótidos adxacentes, principalmente substitucións en dous nucleótidos adxacentes, pero tamén se observaron substitucións en tres nucleótidos adxacentes. <ref>Buettner VL, Hill KA, Halangoda A, Sommer SS. 1999. Tandem-based mutations occur in mouse liver and adipose tissue preferentially as G:C to T:A transversions and accumulate with age. Environ Mol Mutagen 33:320–324.</ref>
 
== Estudos filoxenéticos ==
Os indeis definidos como insercións ou delecións, poden utilizarse como marcadores xenéticos de poboacións naturais, especialmente en estudos [[filoxenia|filoxenéticos]]. <ref name="Vali2008">{{Cita publicación periódica |author=Väli U, Brandström M, Johansson M, Ellegren H |title=Insertion-deletion polymorphisms (indels) as genetic markers in natural populations |journal=BMC Genetic |year=2008 |volume=9 |pages=8 |pmid=18211670 |doi=10.1186/1471-2156-9-8 |pmc=2266919}}</ref><ref name="Erixon2008">{{Cita publicación periódica |author=Erixon P, Oxelman B |title=Whole-gene positive selection, elevated synonymous substitution rates, duplication, and indel evolution of the chloroplast clpP1 gene |journal=PLoS ONE |year=2008 |volume=3 |issue=1 |pages=e1386 |pmid=18167545 |doi=10.1371/journal.pone.0001386 |pmc=2148103 |editor1-last=Volff |editor1-first=Jean-Nicolas}}</ref>
 
Os [[indel sinatura conservado|indeis sinatura conservados]] son moi importantes nos estudos filoxenéticos.
 
== Indel e corremento da pauta de lectura ==
Liña 138 ⟶ 133:
}}</ref>
Un cambio de tipo indel dunha soa base do ADN que codificaba parte dun [[ARNm]] orixina un "corremento da pauta de lectura" á hora de [[tradución (proteínas)|traducir]] o ARNm e podería tamén orixinar a aparición dun [[codón de parada|codón de stop]] inapropiado. Os indeis que non son múltiplos de 3 son especialmente raros nas rexións codificantes, pero relativamente comúns en rexións non codificantes (onde o cambio non produce danos). Calcúlase que cada persoa ten entre 192 e 280 indeis de corremento da pauta de lectura <ref>{{Cita publicación periódica|last=1000 Genomes Project|first=Consortium|coauthors=Durbin, RM, Abecasis, GR, Altshuler, DL, Auton, A, Brooks, LD, Durbin, RM, Gibbs, RA, Hurles, ME, McVean, GA|title=A map of human genome variation from population-scale sequencing|journal=Nature|date=2010-10-28|volume=467|issue=7319|pages=1061–73|pmid=20981092|doi=10.1038/nature09534|pmc=3042601}}</ref>. Porén, a frecuencia absoluta de indeis na maioría dos xenomas coñecidos, humanos incluídos, tende a ser marcadamente máis baixo ca as substitucións de bases, excepto preto das rexións altamente repetitivas, como os [[homopolímero]]s e [[microsatélite]]s.
 
== Estudos filoxenéticos ==
Os indeis definidos como insercións ou delecións, poden utilizarse como marcadores xenéticos de poboacións naturais, especialmente en estudos [[filoxenia|filoxenéticos]]. <ref name="Vali2008">{{Cita publicación periódica |author=Väli U, Brandström M, Johansson M, Ellegren H |title=Insertion-deletion polymorphisms (indels) as genetic markers in natural populations |journal=BMC Genetic |year=2008 |volume=9 |pages=8 |pmid=18211670 |doi=10.1186/1471-2156-9-8 |pmc=2266919}}</ref><ref name="Erixon2008">{{Cita publicación periódica |author=Erixon P, Oxelman B |title=Whole-gene positive selection, elevated synonymous substitution rates, duplication, and indel evolution of the chloroplast clpP1 gene |journal=PLoS ONE |year=2008 |volume=3 |issue=1 |pages=e1386 |pmid=18167545 |doi=10.1371/journal.pone.0001386 |pmc=2148103 |editor1-last=Volff |editor1-first=Jean-Nicolas}}</ref>
 
Os [[indel sinatura conservado|indeis sinatura conservados]] son moi importantes nos estudos filoxenéticos.
 
== Notas ==