=== Complexos proteicos transitorios e permanentes/estables ===
Os complexos proteicos transitorios fórmanse e desfanse transitoriamenteen pouco tempo ''in vivo'', mentres que os complexos permanentes teñen unha vida media relativamente longa. Normalmente, as interaccións obrigadas ([[interaccións proteína-proteína]] nun complexo obrigado) son permanentes, mentres que as interaccións non obrigadas poden ser permanentes ou transitorias.<ref name = "Amoutzias_2010"/> Nótese que non hai unha distinción clara entre as interaccións obrigadas e non obrigadas, senón que o que hai é un continuo entre elas, que depende de varias condicións, por exemplo o [[pH]], concentración de proteínas etc.<ref name="pmid12853464">{{cite journal | author = Nooren IM, Thornton JM | title = Diversity of protein-protein interactions | journal = EMBO J. | volume = 22 | issue = 14 | pages = 3486–92 |date=July 2003 | pmid = 12853464 | pmc = 165629 | doi = 10.1093/emboj/cdg359 }}</ref> Porén, hai importantes diferenzas nas propiedades das interaccións transitorias e as das permanetes/estables, xa que as estables están moi conservadas e as transitorias moito menos conservadas, e dúas proteínas que interaccionan nunha interacción estbleestable teñen unha maior tendencia a ser coexpresadas que as que interveñen en interaccións transitorias (de feito, a probabilidade de coexpresión entre dúas proteínas que interaccionan transitoriamente non é maior que a de dúas proteínas calquera tomadas aleatoriamente), e as interaccións transitorias están moitomenosmoito menos colocalizadas que as interaccións estables.<ref name="pmid17535438">{{cite journal | author = Brown KR, Jurisica I | title = Unequal evolutionary conservation of human protein interactions in interologous networks | journal = Genome Biol. | volume = 8 | issue = 5 | pages = R95 | year = 2007 | pmid = 17535438 | pmc = 1929159 | doi = 10.1186/gb-2007-8-5-r95 }}</ref> Con todo, malia o seu carácter transitoriopouco duradeiro, as interaccións transitorias son moi importantes para a bioloxía celular: o interactoma humano enriquécese con esas interaccións, estas interaccións son os protagonistas dominantes da [[regulación xénica]] e a [[transdución de sinais]], e as proteínas con ''rexións desordenadas intrinsecamente'' (IDR: rexións das proteínas que mostran estruturas interconvertibles dinámicas no estado nativo) son máis abondosas nas interaccións de sinalización e reguladoras transitorias.<ref name = "Amoutzias_2010"/>
