O SIB desenvolve e mantén [[base de datos|bases de datos]] de categoría internacional, como [[Swiss-Prot|UniProtKB/Swiss-Prot]] (base de datos de secuencias de proeínasproteínas [[curación de contidos|curada]] que ten un alto nivel de anotación), [[neXtProt]] (plataforma de coñecementos de proteínas centrada en humanos), o repositorio [[SWISS-MODEL]] (modelos de estrturas de proteínas tridimensionais), [[STRING]] (redes de interaccións de proteínas para bioloxía de sistemas), SwissRegulon (redes regulatorias da transcrición de todoo xenoma), Eukaryotic Promoter Database ([http://epd.vital-it.ch/ EPD]), SWISS-2DPAGE (base de datos de [[electroforese en xel]] bidimensional), WORLD-2DPAGE Repository (repositorio de xeles bidimensionais), mirz (atlas de expresión dos [[ARN pequeno]]s), [[CLIPZ]] (bases de datos de sitios de unión de proteínas que se unen ao ARN), [[PROSITE]] ([[familia proteica|familias]] e [[dominio proteico|dominios proteicos]]), MyHits (secuencias e motivos de proteínas), CleanEx (datos de [[expresión xénica]]), Bgee (base de datos para recuperar e comparar os patróns da exresión de xenes entre especies animais), OpenFlu (bases de datos de virus da influenza animais e humanos), [[ViralZone]] (portal para entradas de UniProtKB virais), GlycoSuiteDB (base de datos de [[glicano]]s), SugarBindDB (base de datos de unión a azucres de patóxenos ou ''Pathogen Sugar-Binding Database''), [[OrthoDB]] (o catálogo xerárquico de [[ortólogo]]s eucariotas), miROrtho (o catálogo de xenes animais de [[microARN]]), e ImmunoDB (xenes inmunorrelacionados de insectos e familias de xenes).
