InterPro: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Liña 63:
;PIRSF : O sistema de clasificación de proteínas é unha rede con moitos niveis de diversidade de secuencia de superfamilias e subfamilias que reflicte as relacións [[evolución|evolutivas]] de proteínas de lonxitude completa e dominios. A unidade de clasificación PIRSF primaria é a familia homeomórfica, cuxos membros son tanto [[homoloxía (bioloxía)|homólogos]] (que evolucionaron a partir dun antepasado común) coma homeomórficas (que comparten unha similaridade de secuencia de lonxitude completa e unha arquitectura de dominio común).
;[[PRINTS]] : É un compendio de "pegadas dactilares" (''fingerprints'') de proteínas. Unha "pegada dactilar" é un grupo de motivos conservados usados para caracterizar unha familia proteica; o seu poder diagnóstico é refinado por un escaneado iterativo de UniProt. Usualmente os motivos non se solapan, senón que están separados ao longo da secuencia, aínda que poden tamén estar contiguos no espazo tridimensional. Estas "pegadas dactilares" poden codificar [[pregamento de proteínas|pregamentos de proteínas]] e funcionalidades de xeito máis flexible e potente do que se pode con motivos únicos, e a súa gran potencia de diagnóstico deriva do contexto mutuo ofrecido polos motivos veciños.
;ProDom : Base de datos de dominios proteicos que consta dunha compilación automática de
;[[PROSITE]] : É unha base de datos de familias e dominios
;[[Simple Modular Architecture Research Tool|SMART]] : Permite a identificación e anotación de dominios xeneticamente móbiles e a análise de arquitecturas de dominios. Son detectables máis de 800 familias de dominios que se encontran en proteínas asociadas coa [[cromatina]], a sinalización, e extracelulares. Estes dominios están amplamente anotados en canto á súa distribución filética, clase funcional, estruturas terciarias e residuos importantes funcionalmente.
;[[SUPERFAMILY]] : É unha biblioteca de perfís de modelos de Markov ocultos que representan todas as proteínas de estrutura descoñecida. A biblioteca está baseada na clasificación [[Structural Classification of Proteins (base de datos)|SCOP]] das proteínas: cada modelo corresponde a un dominio SCOP e pretende representar a [[superfamilia proteica|superfamilia]] SCOP completa á que pertence o dominio. SUPERFAMILY foi utilizada para realizar asignacións estruturais de todos os xenomas completamente secuenciados.
;[[TIGRFAMs]] : É unha colección de familias de proteínas, que presenta aliñamentos de secuencias múltiples revisados, modelos de Markov ocultos e anotacións, que proporciona unha ferramenta para identificar proteínas funcionalmente relacionadas baseadas na homoloxía de secuencia. Estas entradas, que son o que se chama "equivalogs", agrupan proteínas homólogas que están conservadas con respecto á súa función.
== Acceso ==
| |||