InterPro: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 63:
;PIRSF : O sistema de clasificación de proteínas é unha rede con moitos niveis de diversidade de secuencia de superfamilias e subfamilias que reflicte as relacións [[evolución|evolutivas]] de proteínas de lonxitude completa e dominios. A unidade de clasificación PIRSF primaria é a familia homeomórfica, cuxos membros son tanto [[homoloxía (bioloxía)|homólogos]] (que evolucionaron a partir dun antepasado común) coma homeomórficas (que comparten unha similaridade de secuencia de lonxitude completa e unha arquitectura de dominio común).
;[[PRINTS]] : É un compendio de "pegadas dactilares" (''fingerprints'') de proteínas. Unha "pegada dactilar" é un grupo de motivos conservados usados para caracterizar unha familia proteica; o seu poder diagnóstico é refinado por un escaneado iterativo de UniProt. Usualmente os motivos non se solapan, senón que están separados ao longo da secuencia, aínda que poden tamén ser contiguos no espazo tridimensional. Estas "pegadas dactilares" poden codificar [[pregamento de proteínas|pregamentos de proteínas]] e funcionalidades de xeito máis flexible e potente do que se pode con motivos únicos, e a súa gran potencia de diagnóstico deriva do contexto mutuo permitido polos motivos veciños.
;ProDom : Base de datos de dominios proteicos que consta dunha compilación automática de dominis homólogos. As versións actuais de ProDom constrúense usando un procedemento novo baseado en buscas PSI-BLAST recursivas.
;ProDom : domain database consists of an automatic compilation of homologous domains. Current versions of ProDom are built using a novel procedure based on recursive PSI-BLAST searches.
;[[PROSITE]] : É unha base de datos de familias e dominios deproteínas. Consta de sitios bioloxicamente significativos das proteínas, patróns e perfís que axudan a identificar con fiabilidade a que familia coñecida (se existe) pertence unha nova secuencia.
;[[PROSITE]] : is a database of protein families and domains. It consists of biologically significant sites, patterns and profiles that help to reliably identify to which known protein family (if any) a new sequence belongs.
;[[Simple Modular Architecture Research Tool|SMART]] : allows the identification and annotation of genetically mobile domains and the analysis of domain architectures. More than 800 domain families found in signalling, extracellular and chromatin-associated proteins are detectable. These domains are extensively annotated with respect to phyletic distributions, functional class, tertiary structures and functionally important residues.
;[[SUPERFAMILY]] : is a library of profile hidden Markov models that represent all proteins of known structure. The library is based on the [[Structural Classification of Proteins database|SCOP]] classification of proteins: each model corresponds to a SCOP domain and aims to represent the entire SCOP [[Protein superfamily|superfamily]] that the domain belongs to. SUPERFAMILY has been used to carry out structural assignments to all completely sequenced genomes.