InterPro: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
traducido de den:InterPro
 
Miguelferig (conversa | contribucións)
Liña 69:
;[[TIGRFAMs]] : is a collection of protein families, featuring curated multiple sequence alignments, hidden Markov models (HMMs) and annotation, which provides a tool for identifying functionally related proteins based on sequence homology. Those entries which are "equivalogs" group homologous proteins which are conserved with respect to function.
 
== AccessAcceso ==
TheA databasebase isde availabledatos forestá text-dispoñible andpara sequence-basedbuscas searchesbaseadas viaen asecuencias e textos por medio dun [http://www.ebi.ac.uk/interpro webserverservidor web], ande forpara downloaddescargas viapor medio de [ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro anonymous FTP anónima]. LikeComo otheroutras bases de datos do [[EuropeanInstituto Europeo Bioinformaticsde InstituteBioinformática|EBI]] databases, itos isdatos inestán theen [[publicdominio domainpúblico]], sincexa que itso contentseu cancontido bepode usedutilizarse "bypor anycalquera individualindividuo ande forpara anycalquersa purposepropósito".<ref name=termsofuse>http://www.ebi.ac.uk/Information/termsofuse.html</ref>
 
UsersOs canusuarios alsopoden usetamén theusar signature scanningo software de escaneado de sinaturas, [https://code.google.com/p/interproscan/ '''InterProScan'''], if theyse haveteñen novelnovas sequencessecuencias thatque requireprecisan characterisationcaracterixzación.<ref name=pmid15980438>{{Cite journal | first1 = E. .
| last4 = Harte | first2 = V. .
| last2 = Silventoinen
Liña 91:
| last5 = Mulder
| doi = 10.1093/nar/gki442
}}</ref> InterProScan isé frequentlyusada usedfrecuentemente inen [[genomeproxectos projectsxenoma]] inpara orderobter tounha obtainprimeira acaracterización "first-pass"inicial characterisationdo ofxenoma thede genome of interestinterese.<ref name="pmid11237011">{{Cite journal | first1 = E. S.
| last1 = Lander
| authorlink1 = Eric Lander
Liña 149:
| pmid = 12364791
| doi = 10.1126/science.1076181
|bibcode = 2002Sci...298..129H | display-authors = 29 }}</ref> {{AsEn febreiro de of|2013|02}}, thea publicversión versionpública ofde InterProScan (v4.x) isestá [[Perl|baseada en Perl-based]], however,aínda aque newunha Java-basednova architecturearquitectura isbaseada underen developmentJava está baixo desenvolvemento, whiche willformará formo thenúcleo corede of InterProScan v5.<ref name=i5codebase>https://code.google.com/p/interproscan/</ref>
 
ToPara citecitar aun particularartigo InterProdeterminado articlede InterPro inen Wikipedia, useo theuso templatedun ofmodelo theda formforma {{tlx|InterPro|IPRxxxxxx}}, whereonde IPRxxxxxx isé an InterProun [[Accessionnúmero numberde acceso (bioinformaticsbioinformática)|accessionnúmero numberde acceso]] de InterPro, forpor instanceexemplo {{InterPro|IPR000001}}.
 
InterPro aimsten tocomo releaseobxectivo datapoñer tonovos thedatos publicen everydominio público cada 8 weekssemanas, typicallytipicamente un withindía adespois dayda ofaparición theen [[UniProtKB]] releasedos ofdatos thedas samemesmas proteinsproteínas.
 
== Notas ==