DrugBank: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Liña 4:
 
A última versión que saíu desta base de datos é a 4.0, a cal contén 7677 entradas de fármacos incluíndo 1558 fármacos de [[pequena molécula|pequenas moléculas]] aprobados pola [[FDA]] norteamericana, 155 fármacos biotecnolóxicos ([[proteína]]/[[péptido]]) aprobados pola FDA, 87 [[nutracéutico]]s e uns 6000 [[fármaco experimental|fármacos experimentais]].<ref name="pmid24203711">{{cite journal |title=DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism|last=Law|first=V|coauthors=Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS.|journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2014|volume=42|issue=Database issue|page=D1091-7|pmid=24203711|doi=10.1093/nar/gkt1068|pmc=3965102}}</ref> Ademais, contén 4270 proteínas non redundantes (é dicir, secuencias de dianas de fármacos/[[encima]]s/transportadores/carrexadores) que están ligadas ás entradas destes fármacos. [[Ficheiro:DrugBank drugcard.png|miniatura|esquerda|Fig. 1. DrugBank DrugCard.]]
Cada entrada de DrugCard (Fig. 1) contén maísmáis de 200 campos de datos coa metade da información dedicada a dar datos de fármacos/compostos químicos e a outra metade dedicada a datos de dianas de fármacos ou datos de proteínas.<ref name="pmid24203711" />
 
Catro bases de datos adicionais, que son: HMDB,<ref name="pmid18953024">{{cite journal |title=HMDB: a knowledgebase for the human metabolome|last=Wishart|first=DS|coauthors=Guo, AC, Eisner, R, Young, N, Gautam, B, Hau, DD, Psychogios, N, Dong, E, Bouatra, S, Mandal, R, Sinelnikov, I, Xia, J, Jia, L, Cruz, JA, Lim, E, Sobsey, CA, Shrivastava, S, Huang, P, Liu, P, Fang, L, Peng, J, Fradette, R, Cheng, D, Tzur, D, Clements, M, Lewis, A, De Souza, A, Zuniga, A, Dawe, M, Xiong, Y, Clive, D, Greiner, R, Nazyrova, A, Shaykhutdinov, R, Li, L, Vogel, HJ, Forsythe, I|journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2009|volume=37|issue=Database issue|page=D603-10|doi=10.1093/nar/gkn810|pmid=18953024|pmc=2686599}}</ref> T3DB,<ref name="pmid19897546">{{cite journal |title=T3DB: a comprehensively annotated database of common toxins and their targets.|last=Lim|first=E|author2=Pon A |author3=Djoumbou Y |author4=Knox C |author5=Shrivastava S |author6=Guo AC |author7=Neveu V |author8=Wishart DS. |journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2010|volume=38|issue=Database issue|page=D781-6|doi=10.1093/nar/gkp934|pmid= 19897546|pmc=2808899}}</ref> SMPDB <ref name="pmid24203708">{{cite journal |title=Small Molecule Pathway Database.|last=Jewison|first=T|author2=Su Y |author3=Disfany FM |journal=Nucleic Acids Research|date=Jan 2014|volume=42|issue=Database issue|page=D478-84|doi=10.1093/nar/gkt1067|pmid=24203708 |pmc=3965088|display-authors=etal}}</ref> e FooDB forman tamén parte do paquete xeral de bases de datos [[metabolómica]]s/[[quimioinformática]]s. A HMDB contén información equivalente de máis de 40000 [[metabolito]]s humanos, T3DB contén información de 3100 [[toxina]]s comúns e [[contaminante]]s ambientais, SMPDB contén diagramas de rutas de case 700 [[vía metabólica|vías metabólicas]] humanas e vías de enfermidades, e FooDB contén información equivalente sobre ~28000 compoñentes de alimentos e [[aditivo alimentario|aditivos alimentarios]].