Diferenzas entre revisións de «Elemento rico en AU»

m
Bot: Cambio o modelo: Cite journal; cambios estética
m (Bot: Cambio o modelo: Cite journal; cambios estética)
Os '''elementos ricos en adenilato-uridilato''' ou '''elementos ricos en AU''' (ou '''ARE'''s, do inglés ''AU-rich elements'') son secuencias de ARN que se encontran nas rexións [[3' UTR]] de moitos [[ARN mensaxeiros]] que codifican [[protooncoxene]]s, [[factor de transcrición|factores de transcrición]] nuclear, e [[citocina]]s. Os elementos ricos en AU son un dos determinantes máis comúns da estabilidade do ARN en células de mamíferos.<ref>{{citeCita publicación journalperiódica|last=Chen|first=Chyi-Ying A.|coauthors=Shyu, Ann-Bin|title=AU-rich elements: characterization and importance in mRNA degradation|journal=Trends In Biochemical Science|year=1995|month=November|volume=20|issue=11|pages=465–470|pmid=8578590|doi=10.1016/S0968-0004(00)89102-1}}</ref>
 
Un elemento ricos en AU defínese como unha rexión dun [[ARNm]] con abundancia das [[base nitroxenada|bases]] [[adenina]] e [[uridina]]. Xeralmente marcan o ADN para a degradación.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica |author=C Barreau, L Paillard and H B Osborne |title=AU-rich elements and associated factors: are there unifying principles? |journal=Nucleic Acids Res |volume=33 |pages=7138–7150 |year=2006 |pmid=16391004 |doi=10.1093/nar/gki1012 |issue=22 |pmc=1325018}}</ref><ref>{{citeCita journalpublicación periódica |author=Shaw G, Kamen R |title=A conserved AU sequence from the 3' untranslated region of GM-CSF mRNA mediates selective mRNA degradation |journal=Cell |volume=46 |issue=5 |pages=659–67 |year=1986 |month=August |pmid=3488815 |doi=10.1016/0092-8674(86)90341-7}}</ref>
A degradación do ARN dirixida polos elementos ricos en AU está influenciada por moitos factores exóxenos, como a presenza de [[éster]]es [[forbol]], [[ionóforo]]s de calcio, citocinas, e inhibidores da transcrición.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica|last=Chen|first=Chyi-Ying A.|coauthors=Shyu, Ann-Bin|title=AU-rich elements: characterization and importance in mRNA degradation|journal=Trends In Biochemical Science|year=1995|month=November|volume=20|issue=11|pages=465–470|pmid=8578590|doi=10.1016/S0968-0004(00)89102-1}}</ref> Estas observacións suxiren que os elementos ricos en AU xogan un papel crítico na [[regulación da expresión xénica|regulación]] da [[transcrición xenética|transcrición]] xénica durante o crecemento celular e [[diferenciación celular|diferenciación]], e a [[inmunidade (medicina)|resposta inmunitaria]].<ref>{{citeCita journalpublicación periódica|last=Chen|first=Chyi-Ying A.|coauthors=Shyu, Ann-Bin|title=AU-rich elements: characterization and importance in mRNA degradation|journal=Trends In Biochemical Science|year=1995|month=November|volume=20|issue=11|pages=465–470|pmid=8578590|doi=10.1016/S0968-0004(00)89102-1}}</ref>
 
Os elementos ricos en AU divídense en tres clases con diferentes secuencias. A mellor caracterizada é a dos elementos ricos en AU que teñen unha secuencia central de AUUUA dentro de secuencias ricas en U (por exemplo WWWU(AUUUA)UUUW, onde W é A ou U). Isto encóntrase dentro dunha secuencia de 50-150 bases, e a miúdo se requiren repeticións da secuencia central AUUUA para que funcionen.
 
Varias [[proteína]]s (por exemplo, HuA, HuB, HuC, HuD e HuR) únense a estes elementos e estabilizan o ARNm mentres que outras (AUF1, TTP, BRF1, TIA-1, TIAR, e KSRP) destabilízano; os [[miARN]]s poden tamén unirse a algúns deles.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica |author= Federico Bolognani and Nora Perrone-Bizzozero |title=RNA-protein interactions and control of mRNA stability in neurons |journal=J Neurosci Res |volume=86 |pages=481–489 |year=2008 |pmid=17853436 |doi=10.1002/jnr.21473 |issue= 3}}</ref> A proteína [[HuD]] (tamén chamada ELAVL4) únese aos elementos ricos en AU, aumentando a vida media dos ARNm que teñen estes elementos nas [[neurona]]s durante o desenvolvemento e plasticidade do cerebro.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica |author=Nora Perrone-Bizzozero and Federico Bolognani |title=Role of [[HuD]] and other RNA-binding proteins in neural development and plasticity |journal=J Neurosci Res |volume=68 |pages=121–126 |year=2002 |pmid=11948657 |doi=10.1002/jnr.10175 |issue=2}}</ref>
 
[[AREsite]] é unha base de datos para os xenes que conteñen elementos ricos en AU ou AREs que foi desenvolvida recentemente co obxectivo de fornecer información sobre a caracterización bioinformática detallada de elementos ricos en AU.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica |author=Gruber AR, Fallmann J, Kratochvill F, Kovarik P, Hofacker IL |title=AREsite: a database for the comprehensive investigation of AU-rich elements |journal=Nucleic Acids Res |volume=39 |pages=D66–9 |year=2011 |pmid=21071424 |doi=10.1093/nar/gkq990 |issue=Database issue |pmc=3013810}}</ref>
 
== Notas ==
{{Listaref}}
 
== Véxase tamén ==
=== Ligazóns externas ===
* [http://www.cell.com/content/article/abstract?uid=PII0092867486903417 Original publication discovering AU-rich elements]
* [http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/245/4920/852 mRNA Translational blockade by AU-rich elements]
* [http://transterm.otago.ac.nz/RNAMotif.html Brief introduction to mRNA regulatory elements]
* [http://brp.kfshrc.edu.sa/ARED/ ARED: AU-rich element database]
* [http://mrna.otago.ac.nz/cgi-bin/tt_data_browse/RNAMotif?PatID=T0024 Transterm page for AU-Rich Element]
* [http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/AREsite.cgi AREsite: An online resource for the analysis of AREs]
 
[[Categoría:ARN]]
393.002

edicións