Streptomyces: Diferenzas entre revisións

''Streptomyces'' é o xénero tipo da [[familia (bioloxía)|familia]] ''[[Streptomycetaceae]]''<ref name=Anderson2001>{{citeCita journalpublicación periódica |last1=Anderson |first1=AS |last2=Wellington |first2=Elizabeth |year=2001 |title=The taxonomy of ''Streptomyces'' and related genera. |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |volume=51 |issue=3 |pages=797–814 }}</ref> e actualmente comprende unhas 576 [[especies]], número que se incrementa cada ano.<ref name=Labeda2011> Labeda, D. P. (2010). "Multilocus sequence analysis of phytopathogenic species of the genus Streptomyces". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 61 (10): 2525. doi:10.1099/ijs.0.028514-0.</ref> As cepas [[acidofílico|acidofílicas]] e ácido-tolerantes que foron clasificadas inicialmente neste xénero foron movidas máis tarde ao xénero ''[[Kitasatospora]]'' (1997) <ref> Zhang, Z.; Wang, Y.; Ruan, J. (1997). "A Proposal to Revive the Genus Kitasatospora (Omura, Takahashi, Iwai, and Tanaka 1982)". International Journal of Systematic Bacteriology 47 (4): 1048–1054. doi:10.1099/00207713-47-4-1048. PMID 9336904.</ref> e ''[[Streptacidiphilus]]'' (2003).<ref> Kim, S. B.; Lonsdale, J.; Seong, C. N.; Goodfellow, M. (2003). "Streptacidiphilus gen. Nov., acidophilic actinomycetes with wall chemotype I and emendation of the family Streptomycetaceae (Waksman and Henrici (1943)AL) emend. Rainey et al. 1997". Antonie van Leeuwenhoek 83 (2): 107–116. doi:10.1023/A:1023397724023. PMID 12785304.</ref> A nomenclatura das especies baséase xeralmente na cor das súas [[hifa]]s e [[espora]]s.

O xénero ''Streptomyces'' comprende bacterias filamentosas [[Gram positiva]]s [[organismo aeróbico|aeróbicas]], que producen hifas vexetativas ben desenvolvidas (entre 0,5-2,0&nbsp;µm de diámetro) con ramificacións. Forman un complexo [[micelio]] de substrato que lles axuda a captar os compostos orgánicos dos seus substratos.<ref name=Chater/> Aínda que o micelio e as [[hifa|hifas aéreas]] que xorden del non son motís, conseguen mobilidade mediante a dispersión das esporas que forman.<ref name=Chater/> A superficie das esporas pode ser pelosa, rugosa, lisa, espiñenta ou verrugosa.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica |last1=Dietz |first1=Alma |last2=Mathews |first2=John |year=1971 |title=Classification of ''Streptomyces'' spore surfaces into five groups. |journal=Applied Microbiology |volume=21 |issue=3 |pages=527–533 }}</ref> Nalgunhas especies, as hifas aéreas constan de longos filamentos rectos, que portan 50 esporas ou máis a intervalos máis ou menos regulares, dispostas en espiral (verticilos). Cada rama dun verticilo produce, no seu ápice, unha umbela que leva desde dúas a varias cadeas de esporas esféricas ou elipsoidais lisas ou rugosas.<ref name=Chater> Chater, Keith (1984). Losick, Richard, ed. Microbial development [Morphological and physiological differentiation in Streptomyces]. pp. 89–115. ISBN 978-0-87969-172-1. Retrieved 1-19-2012.</ref> Algunhas cepas forman curtas cadeas de esporas sobre as hifas do substrato. Algunhas cepas producen estruturas de tipo esclerocio, picnidio, esporanxio e sinnemato.

O [[xenoma]] completo da cepa "''S. coelicolor'' A3(2)" publicouse en 2002.<ref name=Bentley_2002>{{citeCita journalpublicación periódica | author = Bentley SD, ''et al.'' | title = Complete genome sequence of the model actinomycete ''Streptomyces coelicolor'' A3(2) | journal = Nature | year = 2002 | volume = 417 | issue = 6885| pages = 141–147 | doi = 10.1038/417141a |pmid=12000953}}</ref> Naquela época pensábase que o xenoma de "''S. coelicolor A3(2)''" era o que contiña o maior número de [[xene]]s de todas as bacterias (despois veríase que o de ''S. scabies'' era aínda meirande).<ref name=Bentley_2002/> O cromosoma ten 8.667.507 [[par de bases|bp]] cun [[contido G+C]] de 72,1%, e prediciuse que contén 7.825 xenes que codifican proteínas.<ref name=Bentley_2002/> Taxonomicamente, "''S. coelicolor'' A3(2)" pertence á especie ''[[Streptomyces violaceoruber|S. violaceoruber]]'', e non está descrita validamente como unha especie separada; a cepa "''S. coelicolor'' A3(2)" non debe confundirse coa verdadeira ''[[Streptomyces coelicolor|S. coelicolor]]'' (Müller), aínda que a miúdo se refiran a ela por conveniencia simplemente como ''S. coelicolor'' (sen indicar a letra e número de cepa).<ref> Chater, K. F.; Biró, S.; Lee, K. J.; Palmer, T.; Schrempf, H. (2010). "The complex extracellular biology of Streptomyces". FEMS Microbiology Reviews 34 (2): 171–198. doi:10.1111/j.1574-6976.2009.00206.x. PMID 20088961.</ref>

A primeira secuencia xenómica completa de ''[[Streptomyces avermitilis|S. avermitilis]]'' completouse en 2003.<ref name=Ikeda_2003>{{citeCita journalpublicación periódica | author = Ikeda H; Ishikawa J; Hanamoto A; Shinose M; Kikuchi H; Shiba T; Sakaki Y; Hattori M; Omura S | title= Complete genome sequence and comparative analysis of the industrial microorganism ''Streptomyces avermitilis'' | journal = Nat. Biotechnol. | year = 2003 | volume = 21 | issue = 5| pages = 526–531 | url = http://www.nature.com/cgi-taf/DynaPage.taf?file=/nbt/journal/v21/n5/abs/nbt820.html | pmid= 12692562 | doi = 10.1038/nbt820}}</ref> Estes xenomas forman cada un un cromosoma con estrutura liñal, a diferenza da maioría dos cromosomas bacterianos, que son circulares.<ref name="Dyson2011">{{Cita libro|author=Paul Dyson|title=Streptomyces: Molecular Biology and Biotechnology|url=http://books.google.com/books?id=3z9_QwFumi8C|accessdate=16 January 2012|date=1 January 2011|publisher=Horizon Scientific Press|isbn=978-1-904455-77-6|page=5}}</ref> A secuencia xenómica de ''S. scabies'', outro membro do xénero con capacidade de causar unha enfermidade nas [[pataca]]s, determinouse no ''[[Sanger Institute|Wellcome Trust Sanger Institute]]''. Con 10,1 Mbp de longo e 9.107 xenes codificantes provisionais, é o xenoma máis grande secuenciado de ''Streptomyces'', probablemente debido á súa grande [[illa de patoxenicidade]].<ref name="Dyson2011">{{Cita libro|author=Paul Dyson|title=Streptomyces: Molecular Biology and Biotechnology|url=http://books.google.com/books?id=3z9_QwFumi8C|accessdate=16 January 2012|date=1 January 2011|publisher=Horizon Scientific Press|isbn=978-1-904455-77-6|page=15}}</ref><ref>{{cite web|url=http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_scabies|title=Streptomyces scabies|publisher=Sanger Institute|accessdate=2001-02-26}}</ref>

Nos últimos anos os investigadores en [[biotecnoloxía]] empezaron a usar especies de ''Streptomyces'' para a [[expresión heteróloga]] de proteínas. Tradicionalmente, ''[[Escherichia coli]]'' era a especie que se elixía para expresar nela xenes eucariotas, xa que se coñecía ben e era doado traballar con ela.<ref name=Brawner_1991>{{citeCita journalpublicación periódica |author=Brawner M, Poste G, Rosenberg M, Westpheling J |title=''Streptomyces'': a host for heterologous gene expression |journal=Curr Opin Biotechnol |volume=2 |issue=5 |pages=674–81 |year=1991 |pmid=1367716 |doi=10.1016/0958-1669(91)90033-2}}</ref><ref name=Payne_1990>{{citeCita journalpublicación periódica |author=Payne G, DelaCruz N, Coppella S |title=Improved production of heterologous protein from ''Streptomyces lividans'' |journal=Appl Microbiol Biotechnol |volume=33 |issue=4 |pages=395–400 |year=1990 |pmid=1369282 |doi=10.1007/BF00176653}}</ref> Pero a expresión de proteínas eucarióticas en ''E. coli'' ten varios problemas. Ás veces as proteínas non se pregan debidamente, o que pode orixinar a súa insolubilidade, deposición en [[corpo de inclusión|corpos de inclusión]], e a perda de bioactividade do produto.<ref name=Binnie_1997>{{citeCita journalpublicación periódica |author=Binnie C, Cossar J, Stewart D |title=Heterologous biopharmaceutical protein expression in ''Streptomyces'' |journal=Trends Biotechnol |volume=15 |issue=8 |pages=315–20 |year=1997 |pmid=9263479 |doi=10.1016/S0167-7799(97)01062-7}}</ref> Aínda que ''E. coli'' ten mecanismos de [[secreción]], estes teñen baixa eficacia e prodúcese secreción no [[espazo periplásmico]], mentres que a secreción por parte de bacterias [[Gram positiva]]s como ''Streptomyces sp.'' ten lugar directamente no medio extracelular. Ademais, ''Streptomyces spp.'' teñen mecanismos de secreción máis eficaces ca os de ''E.coli''. As propiedades do sistema de secreción son unha avantaxe para a produción industrial de proteínas expresadas heterologamente porque simplifican os pasos subseguintes de purificación do produto e poden incrementar o rendemento. Estas propiedades entre outras fan de ''Streptomyces spp.'' unha alternativa atractiva a outras bacterias como ''E. coli'' e ''[[Bacillus subtilis]]''.<ref name="Binnie_1997"/>

''Streptomyces'' é o principal xénero de bacterias produtor de [[antibiótico]]s, que sintetiza drogas antibacterianas, [[antifúnxico|antifúnxicas]], e antiparasitos, e tamén unha grande variedade doutros compostos bioactivos, como [[droga inmunosupresora|inmunosupresores]].<ref name="pmid11702082">{{citeCita journalpublicación periódica |author=Watve MG, Tickoo R, Jog MM, Bhole BD |title=How many antibiotics are produced by the genus Streptomyces? |journal=Arch. Microbiol. |volume=176 |issue=5 |pages=386–90 |year=2001 |month=November |pmid=11702082 |doi=10.1007/s002030100345 |url=}}</ref> Case todos os compostos bioactivos producidos por ''Streptomyces'' se empezan a formar durante a formación de hifas aéreas a partir do micelio do substrato.<ref name=Chater/>

* [[Fosfomicina]] (de ''[[Streptomyces fradiae|S. fradiae]]'')<ref name="pmid17113999">{{citeCita journalpublicación periódica |author=Woodyer RD, Shao Z, Thomas PM, ''et al'' |title=Heterologous production of fosfomycin and identification of the minimal biosynthetic gene cluster |journal=Chemistry & biology |volume=13 |issue=11 |pages=1171–82 |year=2006 |month=November |pmid=17113999 |doi=10.1016/j.chembiol.2006.09.007 |url=http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1074-5521(06)00340-1}}</ref>

* [[Neomicina]] (de ''S. fradiae'')<ref>{{citeCita journalpublicación periódica|author=Howard T. Dulmage |title=The Production of Neomycin by Streptomyces fradiae in Synthetic Media |journal=Applied Microbiology |volume=1 |issue=2 |date=March 1953 |pages=103–106 |accessdate=2012-01-19 |pmc=1056872 |pmid=13031516}}</ref>

* [[Puromicina]] (de ''[[Streptomyces alboniger|S. alboniger]]'')<ref>{{citeCita journalpublicación periódica|author=L. Sankaran and Burton M. Pogell |url=http://aac.asm.org/content/8/6/721.abstract |title=Biosynthesis of Puromycin in Streptomyces alboniger: Regulation and Properties of O-Demethylpuromycin O-Methyltransferase |journal=Antimicrobial Agents and Chemotherapy |volume=8 |issue=6 |date=1975-12-01 |accessdate=2012-01-19}}</ref>