Diferenzas entre revisións de «Virus de ARN»

m
Bot: Cambio o modelo: Cite journal
m (Bot: Cambio o modelo: Cite book; cambios estética)
m (Bot: Cambio o modelo: Cite journal)
O [[Comité Internacional de Taxonomía de Virus]] (ICTV) clasifica como virus de ARN os que pertencen aos seguintes grupos do sistema de [[clasificación de Baltimore]]: ''Grupo III'', ''Grupo IV'' e ''Grupo V'', e non considera como pertencentes ao grupo dos virus de ARN a aqueles que teñen intermediatos de [[ADN]] no seu ciclo de vida.<ref name="titleListing in Taxonomic Order - Index to ICTV Species Lists">{{cite web |url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/fr-fst-g.htm |title=Listing in Taxonomic Order - Index to ICTV Species Lists |accessdate=2008-04-11 |work=}}</ref> Os virus que teñen ARN como material xenético pero con intermediatos de ADN no seu ciclo de vida denomínanse [[retrovirus]], e son clasificados no ''Grupo VI'' da clasificación de Baltimore. Entre os retrovirus están o [[VIH-1]] e o [[VIH-2]], causantes da [[SIDA]].
 
Outro termo utilizado para os virus de ARN que explicitamente exclúe aos retrovirus é '''ribovirus'''.<ref name="pmid10570172">{{citeCita journalpublicación periódica |author=Drake JW, Holland JJ |title=Mutation rates among RNA viruses |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=96 |issue=24 |pages=13910–3 |year=1999 |month=November |pmid=10570172 |pmc=24164 |doi= 10.1073/pnas.96.24.13910|url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=10570172}}</ref>
 
== Características ==
 
=== Virus de ARN monocatenario e sentido do ARN ===
Os virus de ARN poden clasificarse de acordo co sentido ou polaridade do seu [[ARN]] en tres grupos: virus con ARN con [[Sentido (bioloxía molecular)|sentido negativo]] (ou "antisentido"), virus con ARN de [[Sentido (bioloxía molecular)|sentido positivo]] (ou "sentido"), ou virus con ARN [[ambisentido]]. O ARN viral de sentido positivo é similar ao [[ARNm]] e pode ser [[tradución de proteínas|traducido]] inmediatamente polos ribosomas da célula [[hóspede]]. O ARN viral de sentido negativo é complementario ao ARNm que tería que ser traducido, polo que debe ser convertido primeiro nun ARN complementario de sentido positivo por unha [[ARN polimerase]] antes de que se poida realizar a tradución. Por tanto, un ARN purificado dun virus de sentido positivo pode causar directamente unha infección aínda que pode ser menos infeccioso ca a partícula completa do virus. O ARN purificado dun virus de sentido negativo non é infeccioso por si mesmo, xa que precisa ser [[transcrición xenética|transcrito]] a un ARN de sentido positivo; cada [[virión]] pode ser transcrito a varios ARNs de sentido positivo. Os virus con ARN ambisentido parécense aos de sentido negativo, excepto que tamén traducen xenes da cadea positiva.<ref>{{citeCita journalpublicación periódica |author=Nguyen M, Haenni AL |title=Expression strategies of ambisense viruses |journal=Virus Res. |volume=93 |issue=2 |pages=141–50 |year=2003 |pmid=12782362 | doi = 10.1016/S0168-1702(03)00094-7}}</ref>
 
=== Virus de ARN bicatenario (dsRNA) ===
 
=== Taxas de mutación ===
Os virus de ARN teñen xeralmente unha taxas de [[mutación]] moi altas comparadas coas dos [[virus de ADN]], porque as [[ARN polimerase]]s virais carecen da capacidade de corrección de erros que teñen as [[ADN polimerase]]s.<ref name=Klein>{{Cita libro |author=Klein, Donald W.; Prescott, Lansing M.; Harley, John |title=Microbiology |publisher=Wm. C. Brown |location=Dubuque, Iowa |year=1993 |pages= |isbn=0-697-01372-3 |oclc= |doi= |accessdate=}}</ref> Esta é unha das razóns polas que é máis difícil producir [[vacina]]s efectivas para previr as enfermidades causadas polos virus de ARN.<ref name="pmid3318675">{{citeCita journalpublicación periódica |author=Steinhauer DA, Holland JJ |title=Rapid evolution of RNA viruses |journal=[[Annu. Rev. Microbiol.]] |volume=41 |issue= |pages=409–33 |year=1987 |pmid=3318675 |doi=10.1146/annurev.mi.41.100187.002205 |url=}}</ref>
Os [[retrovirus]] teñen tamén altas taxas de mutación malia utilizaren un intermediato de ADN que se integra no [[xenoma]] do hóspede (e que está sometido á corrección de erros unha vez integrado), porque os erros producidos durante a [[reversotranscrición]] están presentes en ambas as cadeas do ADN antes da integración.<ref name="pmid20846038">{{citeCita journalpublicación periódica |author=Boutwell CL, Rolland MM, Herbeck JT, Mullins JI, Allen TM |title=Viral Evolution and Escape during Acute HIV-1 Infection |journal=[[J. Infect. Dis.]] |volume=202 Suppl 2 |issue= Suppl 2|pages=S309–14 |year=2010 |month=October |pmid=20846038 |doi=10.1086/655653 |url= |pmc=2945609}}</ref>
Algúns xenes de virus de ARN son importantes para os ciclos de replicación viral e neles non son tolerradas as mutacións. Por exemplo, a rexión do xenoma do [[virus da hepatite C]] que codifica as proteínas ''core'' ten unha secuencia moi conservada,<ref name="pmid8058787">{{citeCita journalpublicación periódica
|author=Bukh J, Purcell RH, Miller RH
|title=Sequence analysis of the core gene of 14 hepatitis C virus genotypes
|doi=10.1073/pnas.91.17.8239
|url=
}}</ref> porque contén a estrutura do ARN implicada na formación dun [[sitio interno de entrada ao ribosoma]] ou IRES (que permite o inicio da tradución en medio do ARNm).<ref name="pmid15448367">{{citeCita journalpublicación periódica
|author=Tuplin A, Evans DJ, Simmonds P
|title=Detailed mapping of RNA secondary structures in core and NS5B-encoding region sequences of hepatitis C virus by RNase cleavage and novel bioinformatic prediction methods
Este é o grupo máis grande de virus de ARN con 30 familias. Fixéronse diversos intentos para agrupar estas [[familia (bioloxía)|familias]] en [[orde (bioloxía)|ordes]]. As propostas presentadas estaban baseadas na análise das [[ARN polimerase]]s e están aínda sendo consideradas. Ata agora as suxerencias propostas non tiveron ampla aceptación debido ás dúbidas sobre a conveniencia de que un só xene determine a [[taxonomía]] dun [[clado]].
 
As clasificacións propostas para os virus de ARN de cadea positiva baseadas no estudo do xene da ARN polimerase ARN-dependente establecen tres grupos:<ref name=Koonin>{{citeCita journalpublicación periódica | author = Koonin EV | year = 1991 | title = The phylogeny of RNA-dependent RNA polymerases of positive-strand RNA viruses | url = | journal = J Gen Virol | volume = 72 | issue = 9| pages = 2197–206 }}</ref>
 
I. O grupo de tipo picorna ou Picornavirata, formado por: bimovirus, comovirus, nepovirus, nodavirus, picornavirus, potivirus, sobemovirus e un subconxunto de luteovirus (virus do amarelado da remolacha occidental e virus do enrolamento da folla da pataca).
O supergrupo alfa pode ser ademais dividido en tres clados: o de tipo rubi, de tipo tobamo e de tipo timo.<ref name=Koonin1993>Koonin, EV, Dolja VV (1993) Evolution and taxonomy of positive-strand RNA viruses: implications of comparative analysis of amino acid sequences. Crit Rev Biochem Mol Biol 28:375-430</ref>
 
Traballos adicionais identificaron cinco grupos de virus de ARN de fibra positiva que conteñen, respectivamente, catro, tres, tres, thres e unha orde(s).<ref name=Ward1993>{{citeCita journalpublicación periódica | author = Ward CW | year = 1993 | title = Progress towards a higher taxonomy of viruses | url = | journal = Res Virol | volume = 144 | issue = 6| pages = 419–453 }}</ref> Estas catorce ordes conteñen 31 familias de virus (incluíndo 17 familias de virus de plantas) e 48 xéneros (incluíndo 30 xéneros de virus de plantas). Esta análise suxire que os alphavirus e flavivirus poden separarse en dúas familias, os Togaviridae e os Flaviridae, pero suxire que outras asignacións taxonómicas poden ser incorrectas, como as dos pestivirus, virus da hepatite C, rubivirus, virus da hepatite E e arterivirus. Os coronavirus e torovirus parecen ser familias distintas de distintas ordes e non distintos xéneros da mesma familia como son clasificados actualmente. Os luteovirus parecen ser dúas familias e non unha e o virus da mancha foliar clorótica da mazá parece que non é un closterovirus senón un novo xénero de Potexviridae.
 
; Evolución
** Familia ''[[Togaviridae]]'' - inclúe o virus da [[rubéola]], [[virus do río Ross]], [[virus Sindbis]], [[virus Chikungunya]]
** Familia ''[[Tombusviridae]]''
** Familia ''[[Virgaviridae]]''<ref name=Adams2009>{{citeCita journalpublicación periódica | author = Adams MJ, Antoniw JF, Kreuze J | year = 2009 | title = Virgaviridae: a new family of rod-shaped plant viruses | url = | journal = Arch Virol | volume = 154 | issue = 12| pages = 1967–1972 }}</ref>
 
** Xéneros non asignados
393.002

edicións