Northern blot: Diferenzas entre revisións

NorthernO blottingnorthern allowsblot onepermite toa observeobservación ado particularpatrón gene'sde expressionexpresión patterndun betweenxene tissuesparticular en distintos tecidos, organsórganos, developmentalestadios stagesdo desenvolvemento, environmentalniveis stressde levelsestrés ambiental, pathogeninfeccións infectionde patóxenos, ande overao thelongo coursedo ofcurso dun treatmenttratamento.<ref name="Mori1991" /><ref name="Liang1995" /><ref name=Baldwin1999>Baldwin, D., Crane, V., Rice, D. (1999) A comparison of gel-based, nylon filter and microarray techniques to detect differential RNA expression in plants. Current Opinion in Plant Biol. 2: 96–103.</ref> A Thetécnica techniquefoi hasutilizada beenpara usedmostrar toa showsobreexpresión overexpressionde ofoncoxenes oncogenese anda downregulationregulación ofá tumor-suppressorbaixa genesde inxenes canceroussupresores cellsde whentumores compareden tocélulas cancerosas cando se 'compara co tecido "normal' tissue",<ref name="Streit2009" /> ase welltamén asa theexpresión genexénica expressionno inrexeitamento thede rejection of transplantedórganos organstransplantados.<ref name=Utans1994>{{cite journal | last1 = Utans | first1 = U. | last2 = Liang | first2 = P. | last3 = Wyner | first3 = L. R. | last4 = Karnovsky | first4 = M. J. | last5 = Russel | first5 = M. E. | year = 1994 | title = Chronic cardiac rejection: Identification of five upregulated genes in transplanted hearts by differential mRNA display | url = | journal = Proc. Natl. Acad. Sci. USA | volume = 91 | issue = 14| pages = 6463–6467 | doi = 10.1073/pnas.91.14.6463 | pmid = 8022806 | pmc = 44222 }}</ref> Se Ifse anobserva upregulatedque geneun is[[xene]] observedé byregulado anporque abundancese ofdetecta mRNAunha onabondancia thedo seu ARNm no northern blot thefeito sampleá canmostra, theneste bexene sequencedpode todespois determineser ifsecuenciado thepara genedeterminar isse knowné toun researchersxene orcoñecido ifpolos itinvestigadores isou ase é un noveldescubrimento findingnovo.<ref name="Utans1994" /> Os Thepatróns expressionde patternsexpresión obtainedobtidos underbaixo givenunhas conditionscondicións candeterminadas providepode insightservir intopara thecomprender functionmellor ofa thatfunción genedese xene. Como Sinceo theARN RNAse issepara firstprimeiro separatedpor by sizetamaños, ifse onlyse oneusa probesó typeun istipo usedde variancesonda inas thevariacións levelno ofnivel eachde bandcada onbanda thena membranemembrana canpoden providedar insightunha intoidea thedo size oftamaño thedo productproduto, suggestingo alternativeque splicesuxire productsa ofexistencia de produtos de [[splicing alternativo]] do themesmo samexene geneou ormotivos repetitivede sequencesecuencia motifsrepetidos.<ref name="Durand1993" /><ref name="Gortner1996" /> A Thevariación varianceen intamaño sizedun ofproduto adun genexene productpode cantamén alsoindicar indicate[[deleción]]s deletionsou orerros errorsno in[[procesamento transcriptdo processing.ARN|procesamento Bydo alteringtranscrito]]. theAlterando probea targetdiana usedda alongsonda theutilizada knownna sequencesecuencia itcoñecida, isé possibleposible todeterminar determineque whichrexión regiondo of the RNAARN isse missingperdeu.<ref name="Alberts2008" />

[http://www.medicalgenomics.org/Databases/blotbase/news BlotBase] isé anunha base de datos online databaseque publishingpublica northern blots. BlotBase hasleva publicados overuns 700 published northern blots ofde humanmostras andhumanas mousee samplesde ratos, in overduns 650 genesxenes acrossde moremáis thande 25 differenttipos tissuede types[[tecido (bioloxía)|tecido]].<ref name="Schlamp2008" /> Os Northernnorthern blots canpoden beser searchedbuscados bypor a blotun ID de blot, paperreferencia de referencepublicación, geneidentificador identifierde xene, orou bypor tissuetecido.<ref name="Schlamp2008" /> Os Theresultados resultsdunha ofbúsqueda proporcionan a searchID provide thede blot ID, speciesespecie, tissuetecido, genexene, expressionnivel levelde expesión, blotimaxe imagedo blot (ifse está availabledispoñible), ande linksligazóns toá thepublicación publicationque thatse theorixinaron workno originated fromtraballo.<ref name="Schlamp2008" /> This new database provides sharing of information between members of the science community that was not previously seen in northern blotting as it was in sequence analysis, genome determination, protein structure, etc.