Xenómica: Diferenzas entre revisións

=== Xenómica estrutural ===

{{Artigo principal|Xenómica estrutural}}

A [[xenómica estrutural]] trata de describir a [[estrutura das proteínas|estrutura tridimensional]] de todas as proteínas codificadas nun xenoma.<ref name="marsden2007"/><ref name="brenner2000"/> Esta estratexia baseada no xenoma permite ter un método de alto rendemento para determinar as estruturas por unha combinación de [[predición da estrutura das proteínas|estratexias de modelación e experimentais]]. A principal diferenza entre a xenómica estrutural e a [[predición da etrutura das proteínas|predición estrutural tradicional]] é que a xenómica estrutural trata de determinar a estrutura de todas as proteínas codificadas polo xenoma, en vez de centrarse nunha proteína determinada. Cando se dispón de secuencias de xenomas completos, a predición de estruturas pode facerse máis rapidamente por medio da combinación de métodos de modelaxe e experimentais, especialmente debido a que a dispoñibilidade dun gran número de xenomas secuenciados e estruturas das proteínas resoltas previamente permite aos científicos modelizar a estrutura da proteína sobre a base das estruturas de homólogos previamente resoltos. A xenómica estrutural implica usar moitas estratexias posibles para a determinación da estrutura, como métodos experimentais utilizando secuencias xenómicas ou modelizacións baseadas na secuencia ou homoloxía estrutural dunha proteína de estrutura coñecida ou baseada en principios físicos e químicos para unha prteína sen ningunha homoloxía con ningunha estrutura coñecida. Ao contrario da [[bioloxía estrutural]] tradicional, a determinación da estrutura dunha proteína por medio da xenómica estrutural a miúdo (pero non sempre) faise antes de que se saiba algo sobre a función exercida pola roteína. Isto formula novos retos para a [[bioinformática estrutural]], é dicir, determinar a función da proteína a partir da súa estyruura tridimensional.<ref name="brenner2001"/>

 

=== Epixenómica ===

A [[epixenómica]] é o estudo do conxunto completo de modificacións [[epixenética]]s sobre o material xenético dunha célula, coñecido como [[epixenoma]].<ref name="francis2011"/> As modificacións epixenéticas son modificacións reversibles no ADN celular ou nas [[histona]]s que afecta á expresión xénica sen alterar a secuencia de ADN (Russell 2010 p.&nbsp;475). Dúas das modificacións epixenéticas mellor caracterizadas son a [[metilación do ADN]] e a [[epixenética|modificación de histonas]]. As modificacións epixenéticas xogan un importante papel na expresión xénica e regulación, e están implicadas en numerosos procesos celulares como a [[diferenciación celular|diferenciación]] e desenvolvemento e na xénese de tumores.<ref name="francis2011"/> O estudo da epixenética a niverl global fíxose posible só recentemente por medio da adaptación de ensaios de alto rendemento xenómicos.<ref name="laird2010"/>

 

=== Metaxenómica ===

 

[[Metagenomics]] is the study of ''metagenomes'', [[genetics|genetic]] material recovered directly from [[Natural environment|environmental]] samples. The broad field may also be referred to as environmental genomics, ecogenomics or community genomics. While traditional [[microbiology]] and microbial [[genome sequencing]] rely upon cultivated [[clone (genetics)|clonal]] [[microbiological culture|cultures]], early environmental gene sequencing cloned specific genes (often the [[16S ribosomal RNA|16S rRNA]] gene) to produce a [[microbial ecology|profile of diversity]] in a natural sample. Such work revealed that the vast majority of [[biodiversity|microbial biodiversity]] had been missed by [[Microbiological culture|cultivation-based]] methods.<ref name="Hugenholz1998"/> Recent studies use "shotgun" [[chain termination method|Sanger sequencing]] or massively parallel [[pyrosequencing]] to get largely unbiased samples of all genes from all the members of the sampled communities.<ref name="Eisen2007"/> Because of its power to reveal the previously hidden diversity of microscopic life, metagenomics offers a powerful lens for viewing the microbial world that has the potential to revolutionize understanding of the entire living world.<ref name="MarcoD"/><ref name="MarcoD2011"/>