Xenómica: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Liña 18:
== Áreas de investigación ==
===
{{Artigo principal|Xenómica funcional}}
A [[xenómica funcional]] é unha rama da [[bioloxía molecular]] que ten como obxectivo facer uso da enorme cantidade de datos obtidos nos proxectos xenómicos (como os [[proxecto xenoma|proxectos de secuenciación de xenomas]]) para describir as funcións dos [[xene]]s (e [[proteína]]s) e as interaccións. A xenómica funional céntrase nos aspectos dinámicos como a [[transcrición (xenética)|transcrición]], [[tradución de proteínas|tradución]], e [[interaccións proteína-proteína]], pero non en aspectos estáticos da información xenómica como a [[secuencia de ADN|secuencias de ADN]] ou as estruturas. A xenómica funcional trata de responder cuestións sobre o funcionamento do ADN a nivel de xenes, os transcritos de ARN, e produtos proteicos. Unha característica clave dos estudos de xenómica funcional é a súa estratexia de considerar o xenoma completo para resolver estas cuestións, o que xeralmente implica métodos de alto rendemento en vez da aproximación á cuestión máis tradicional “xene por xene”. A xenómica funcional preocúpase de estudar os patróns de expresión xénica en diversas condicións. As ferramentas máis importantes usadas son as [[micromatriz|micromatrices]] e a [[bioinformática]].
=== Xenómica estrutural ===
{{Artigo principal|Xenómica estrutural}}
[[
A [[xenómica estrutural]] trata de describir a [[estrutura das proteínas|estrutura tridimensional]] de todas as proteínas codificadas nun xenoma.<ref name="marsden2007"/><ref name="brenner2000"/> Esta estratexia baseada no xenoma permite ter un método de alto rendemento para determinar as estruturas por unha combinación de [[predición da estrutura das proteínas|estratexias de modelación e experimentais]]. A principal diferenza entre a xenómica estrutural e a [[predición da etrutura das proteínas|predición estrutural tradicional]] é que a xenómica estrutural trata de determinar a estrutura de todas as proteínas codificadas polo xenoma, en vez de centrarse nunha proteína determinada. Cando se dispón de secuencias de xenomas completos, a predición de estruturas pode facerse máis rapidamente por medio da combinación de métodos de modelaxe e experimentais, especialmente debido a que a dispoñibilidade dun gran número de xenomas secuenciados e estruturas das proteínas resoltas previamente permite aos científicos modelizar a estrutura da proteína sobre a base das estruturas de homólogos previamente resoltos. A xenómica estrutural implica usar moitas estratexias posibles para a determinación da estrutura, como métodos experimentais utilizando secuencias xenómicas ou modelizacións baseadas na secuencia ou homoloxía estrutural dunha proteína de estrutura coñecida ou baseada en principios físicos e químicos para unha prteína sen ningunha homoloxía con ningunha estrutura coñecida. Ao contrario da [[bioloxía estrutural]] tradicional, a determinación da estrutura dunha proteína por medio da xenómica estrutural a miúdo (pero non sempre) faise antes de que se saiba algo sobre a función exercida pola roteína. Isto formula novos retos para a [[bioinformática estrutural]], é dicir, determinar a función da proteína a partir da súa estyruura tridimensional.<ref name="brenner2001"/>
===
{{Artigo principal|Epixenómica}}
A [[epixenómica]] é o estudo do conxunto completo de modificacións [[epixenética]]s sobre o material xenético dunha célula, coñecido como [[epixenoma]].<ref name="francis2011"/> As modificacións epixenéticas son modificacións reversibles no ADN celular ou nas [[histona]]s que afecta á expresión xénica sen alterar a secuencia de ADN (Russell 2010 p. 475). Dúas das modificacións epixenéticas mellor caracterizadas son a [[metilación do ADN]] e a [[epixenética|modificación de histonas]]. As modificacións epixenéticas xogan un importante papel na expresión xénica e regulación, e están implicadas en numerosos procesos celulares como a [[diferenciación celular|diferenciación]] e desenvolvemento e na xénese de tumores.<ref name="francis2011"/> O estudo da epixenética a niverl global fíxose posible só recentemente por medio da adaptación de ensaios de alto rendemento xenómicos.<ref name="laird2010"/>
▲[[File:Argonne's Midwest Center for Structural Genomics deposits 1,000th protein structure.jpg|An example of a protein structure determined by the Midwest Center for Structural Genomics.|thumb|300px]]
===
[[File:Environmental shotgun sequencing.png|thumb|right|upright|Environmental Shotgun Sequencing (ESS) is a key technique in metagenomics. (A) Sampling from habitat; (B) filtering particles, typically by size; (C) Lysis and DNA extraction; (D) cloning and library construction; (E) sequencing the clones; (F) sequence assembly into contigs and scaffolds.]]
Liña 49 ⟶ 47:
==== Human genomics ====
{{Main|Human genome}}
== Aplicacións da xenómica ==
| |||