Diferenzas entre revisións de «Virus de ARN»

m
Bot: Cambio o modelo: Cite book; cambios estética
m (Bot: Cambio o modelo: Cite book; cambios estética)
Outro termo utilizado para os virus de ARN que explicitamente exclúe aos retrovirus é '''ribovirus'''.<ref name="pmid10570172">{{cite journal |author=Drake JW, Holland JJ |title=Mutation rates among RNA viruses |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=96 |issue=24 |pages=13910–3 |year=1999 |month=November |pmid=10570172 |pmc=24164 |doi= 10.1073/pnas.96.24.13910|url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=10570172}}</ref>
 
== Características ==
 
=== Virus de ARN monocatenario e sentido do ARN ===
Os virus de ARN poden clasificarse de acordo co sentido ou polaridade do seu [[ARN]] en tres grupos: virus con ARN con [[Sentido (bioloxía molecular)|sentido negativo]] (ou "antisentido"), virus con ARN de [[Sentido (bioloxía molecular)|sentido positivo]] (ou "sentido"), ou virus con ARN [[ambisentido]]. O ARN viral de sentido positivo é similar ao [[ARNm]] e pode ser [[tradución de proteínas|traducido]] inmediatamente polos ribosomas da célula [[hóspede]]. O ARN viral de sentido negativo é complementario ao ARNm que tería que ser traducido, polo que debe ser convertido primeiro nun ARN complementario de sentido positivo por unha [[ARN polimerase]] antes de que se poida realizar a tradución. Por tanto, un ARN purificado dun virus de sentido positivo pode causar directamente unha infección aínda que pode ser menos infeccioso ca a partícula completa do virus. O ARN purificado dun virus de sentido negativo non é infeccioso por si mesmo, xa que precisa ser [[transcrición xenética|transcrito]] a un ARN de sentido positivo; cada [[virión]] pode ser transcrito a varios ARNs de sentido positivo. Os virus con ARN ambisentido parécense aos de sentido negativo, excepto que tamén traducen xenes da cadea positiva.<ref>{{cite journal |author=Nguyen M, Haenni AL |title=Expression strategies of ambisense viruses |journal=Virus Res. |volume=93 |issue=2 |pages=141–50 |year=2003 |pmid=12782362 | doi = 10.1016/S0168-1702(03)00094-7}}</ref>
 
=== Virus de ARN bicatenario (dsRNA) ===
Os virus de ARN bicatenario son un grupo moi diverso de virus que varían amplamente no seu rango de hóspedes aos que infectan (humanos, outros animais, plantas, [[Fungo (bioloxía)|fungofungos]]s, e [[bacteria]]s), número de segmentos xenómicos que posúen (de un a doce), e organización do [[virión]] (número T ou de triangulación, capas da [[cápsida]], ou torretas). Membros deste grupo son os [[rotavirus]], que producen en todo o mundo [[gastroenterite]] en nenos pequenos, os [[picobirnavirus]], que son os virus que se atopan con máis frecuencia en mostras fecais humanas e doutros animais con ou sen signos de [[diarrea]]. Os [[picobirnavirus]] foron atopados recentemente tamén en mostras do tracto respiratorio de porcos. O [[virus da lingua azul]],<ref name=sobrino7>{{citeCita booklibro |chapterurl=http://www.horizonpress.com/avir|author=Roy P|year=2008|chapter=Molecular Dissection of Bluetongue Virus|title=Animal Viruses: Molecular Biology|publisher=Caister Academic Press|id=[http://www.horizonpress.com/avir isbn=978-1-904455-22-6]}}</ref><ref name=roy2>{{citeCita booklibro |chapterurl=http://www.horizonpress.com/rnav|author=Roy P|year=2008|chapter=Structure and Function of Bluetongue Virus and its Proteins|title=Segmented Double-stranded RNA Viruses: Structure and Molecular Biology|publisher=Caister Academic Press|id=[http://www.horizonpress.com/rnav isbn=978-1-904455-21-9]}}</ref> é un patóxeno economicamente importante do gando vacún e ovino. Nos últimos anos fíxose un importante progreso na determinación, a nivel atómico e subatómico, das estruturas dun número chave de de proteínas virais e das cápsides dos virións de varios virus de ARN de dobre cadea, o que salientou os significativos paralelismos en estrutura e procesos replicativos de moitos destes virus.<ref name=Pattonrnav>{{citeCita booklibro | author = Patton JT (editor). | title = Segmented Double-stranded RNA Viruses: Structure and Molecular Biology | publisher = Caister Academic Press | year = 2008 | url=http://www.horizonpress.com/rnav | id = [http://www.horizonpress.com/rnav isbn = 978-1-904455-21-9]}}</ref>
 
=== Taxas de mutación ===
Os virus de ARN teñen xeralmente unha taxas de [[mutación]] moi altas comparadas coas dos [[virus de ADN]], porque as [[ARN polimerase]]s virais carecen da capacidade de corrección de erros que teñen as [[ADN polimerase]]s.<ref name=Klein>{{citeCita booklibro |author=Klein, Donald W.; Prescott, Lansing M.; Harley, John |title=Microbiology |publisher=Wm. C. Brown |location=Dubuque, Iowa |year=1993 |pages= |isbn=0-697-01372-3 |oclc= |doi= |accessdate=}}</ref> Esta é unha das razóns polas que é máis difícil producir [[vacina]]s efectivas para previr as enfermidades causadas polos virus de ARN.<ref name="pmid3318675">{{cite journal |author=Steinhauer DA, Holland JJ |title=Rapid evolution of RNA viruses |journal=[[Annu. Rev. Microbiol.]] |volume=41 |issue= |pages=409–33 |year=1987 |pmid=3318675 |doi=10.1146/annurev.mi.41.100187.002205 |url=}}</ref>
Os [[retrovirus]] teñen tamén altas taxas de mutación malia utilizaren un intermediato de ADN que se integra no [[xenoma]] do hóspede (e que está sometido á corrección de erros unha vez integrado), porque os erros producidos durante a [[reversotranscrición]] están presentes en ambas as cadeas do ADN antes da integración.<ref name="pmid20846038">{{cite journal |author=Boutwell CL, Rolland MM, Herbeck JT, Mullins JI, Allen TM |title=Viral Evolution and Escape during Acute HIV-1 Infection |journal=[[J. Infect. Dis.]] |volume=202 Suppl 2 |issue= Suppl 2|pages=S309–14 |year=2010 |month=October |pmid=20846038 |doi=10.1086/655653 |url= |pmc=2945609}}</ref>
Algúns xenes de virus de ARN son importantes para os ciclos de replicación viral e neles non son tolerradas as mutacións. Por exemplo, a rexión do xenoma do [[virus da hepatite C]] que codifica as proteínas ''core'' ten unha secuencia moi conservada,<ref name="pmid8058787">{{cite journal
}}</ref>
 
== Replicación ==
Os virus de ARN animais clasifícanse <ref>ICTVdb [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/fr-fst-g.htm]</ref> en tres grupos dependendo do seu xenoma e modo de replicación (e os grupos numéricos baseados na vella [[clasificación de Baltimore]]):
 
* [[Virus de ARN bicatenario]] (Grupo III), que conteñen desde unha a unha ducia de moléculas diferentes de ARN, cada unha das cales codifica unha ou máis proteínas virais.
* [[Virus de ARN monocatenario de sentido positivo]] (Grupo IV), que utilizan o seu xenoma directamente como ARNm, o cal é traducido polos [[ribosoma]]s do hóspede nunha soa proteína que é modificada polo hóspede e por proteínas virais para formar as diversas proteínas que cómpren para a replicación do virus. Unha delas é a [[ARN polimerase ARN-dependente]] (ou ARN replicase), que copia o ARN viral para formar unha forma replicativa de dobre cadea, que á súa vez dirixe a formación de novos virións.
* [[Virus de ARN monocatenario de sentido negativo]] (Grupo V), que deben copiar o seu xenoma utilizando unha [[ARN polimerase ARN-dependente]] para formar ARN de sentido positivo. Isto significa que o virus debe levar con el este [[encima]] ARN replicase. A molécula de ARN de sentido positivo actúa despois como ARNm viral, que é traducido a proteínas polos ribosomas do hóspede. As proteínas resultantes pasan a dirixir a síntese de novos virións, como as proteínas da [[cápsida]] e a ARN replicase, que se usa para producir novas moléculas de ARN de sentido negativo.
 
Os [[retrovirus]] (Grupo VI) teñen un xenoma de ARN monocatenario pero non se consideran xeralmente dentro do grupo dos virus de ARN porque utilizan intermediatos de ADN para replicarse. O encima viral [[reversotranscritase]], que se encontra no interior do virus e se libera cando este se decapsida, converte o ARN viral nunha fibra [[complementariedade (bioloxía molecular)|complementaria]] de ADN, que despois se copia para producir a cadea [[complementariedade (bioloxía molecular)|complementaria]] orixinando unha molécula de ADN viral bicatenario. Despois este ADN intégrase nun cromosoma do hóspede utilizando o encima viral [[integrase]]. A expresión dos xenes codificados nese ADN integrado pode dar lugar á formación de novos virións.
 
== Clasificación ==
 
A clasificación dos virus de ARN sempre foi un asunto complicado. En parte débese ás altas taxas de mutación que presentan os seus xenomas. A clasificación está baseada principalmente no tipo de xenoma (de dobre cadea, ou de cadea simple negativa ou positiva) e no seu número de xenes e organización. Actualemnte recoñécense 5 ordes e 47 familias de virus de ARN. Hai tamén un número de especies e xéneors non asignados.
Relacionados paro diferentes dos virus de ARN son os [[viroide]]s e [[satélite (viroloxía)|virus satélites de ARN]], que se clasifican en grupos á parte.
 
=== Filoxenia dos virus de ARN de cadea positiva ===
 
Este é o grupo máis grande de virus de ARN con 30 familias. Fixéronse diversos intentos para agrupar estas [[familia (bioloxía)|familias]] en [[orde (bioloxía)|ordes]]. As propostas presentadas estaban baseadas na análise das [[ARN polimerase]]s e están aínda sendo consideradas. Ata agora as suxerencias propostas non tiveron ampla aceptación debido ás dúbidas sobre a conveniencia de que un só xene determine a [[taxonomía]] dun [[clado]].
 
As clasificacións propostas para os virus de ARN de cadea positiva baseadas no estudo do xene da ARN polimerase ARN-dependente establecen tres grupos:<ref name=Koonin>{{cite journal | author = Koonin EV | year = 1991 | title = The phylogeny of RNA-dependent RNA polymerases of positive-strand RNA viruses | url = | journal = J Gen Virol | volume = 72 | issue = 9| pages = 2197–206 }}</ref>
; Evolución
 
A evolución dos picornavirus baseada na análise das súas ARN polimerases e [[helicase]]s parece datar a diverxencia dos [[Eukarya|eucariotaeucariotas]]s.<ref name=Koonin2008>Koonin EV, Wolf YI, Nagasaki K, Dolja VV (2008) The Big Bang of picorna-like virus evolution antedates the radiation of eukaryotic supergroups. Nat Rev Microbiol 6(12):925-939</ref> Os seus supostos antepasados poderían ser os [[retroelemento]]s de grupo II bacterianos, a familia de [[protease]]s HtrA e os bacteriófagos de ADN.
 
=== Virus de ARN bicatenario ===
 
Esta análise tamén suxire que os virus de ARN de dobre cadea non están estreitamente relacionados uns con outros senón que pertencen a catro clases adicionais (Birnaviridae, Cystoviridae, Partitiviridae e Reoviridae), e a unha orde adicional (Totiviridae) dun dos tipos de virus de ARN monocatenarios do mesmo subfilo ca os virus de ARN de cadea positiva.
 
== Grupo III - Virus de ARN bicatenario (dsRNA) ==
 
Hai nove familias neste grupo e varios xéneros non asignados e especies recoñecidas.<ref name=Klein/>
 
* Familia ''[[Birnaviridae]]''
* Familia ''[[Chrysoviridae]]''
* Familia ''[[Cystoviridae]]''
* Familia ''[[Endornaviridae]]''
* Familia ''[[Hypoviridae]]''
* Familia ''[[Megabirnaviridae]]''
* Familia ''[[Partitiviridae]]''
* Familia ''[[Picobirnaviridae]]''
* Familia ''[[Reoviridae]]'' - inclúe ''[[Rotavirus]]''
* Familia ''[[Totiviridae]]''
 
* Xéneros non asignados
** ''[[Endornavirus]]''
** ''[[Varicosavirus]]''
 
* Especies non asignadas
** ''[[Virus asociado á debilitación de Sclerotinia sclerotiorum]]''
** ''[[Botrytis porri RNA virus 1]]''
 
== Grupo IV - Virus de ARN monocatenario de sentido positivo ((+)ssRNA) ==
Comprende tres ordes e 33 familias recoñecidas. Ademais, hai varias especies e xéneros non clasificados.
 
* Orde ''[[Nidovirales]]''
** Familia ''[[Arterivirus|Arteriviridae]]''
** Familia ''[[Coronaviridae]]'' - inclúe ''[[Coronavirus]]'', [[SARS]]
** Familia ''[[Mesoniviridae]]''
** Familia ''[[Okavirus|Roniviridae]]''
 
* Orde ''[[Picornavirales]]''
** Familia ''[[Dicistroviridae]]''
** Familia ''[[Iflaviridae]]''
** Familia ''[[Marnaviridae]]''
** Familia ''[[Picornaviridae]]'' - inclúe o ''[[Poliovirus]]'', o virus do [[Rhinovirus|arrefriado común]], o virus da [[hepatite A]]
** Familia ''[[Secoviridae]]'' inclúe a subfamilia ''[[Comoviridae|Comovirinae]]''
** Xénero ''[[Bacillariornavirus]]''
** Xénero ''[[Labyrnavirus]]''
 
* Orde ''[[Tymovirales]]''
** Familia ''[[Alphaflexiviridae]]''
** Familia ''[[Betaflexiviridae]]''
** Familia ''[[Gammaflexiviridae]]''
** Familia ''[[Tymoviridae]]''
 
* Non asignados
** Familia ''[[Alphatetraviridae]]''
** Familia ''[[Alvernaviridae]]''
** Familia ''[[Astroviridae]]''
** Familia ''[[Barnavirus|Barnaviridae]]''
** Familia ''[[Bromoviridae]]''
** Familia ''[[Caliciviridae]]'' - inclúes o [[virus Norwalk]]
** Familia ''[[Carmotetraviridae]]''
** Familia ''[[Closteroviridae]]''
** Familia ''[[Flaviviridae]]'' - inclúe p virus da [[febre amarela]], [[virus do Nilo Occidental]], [[virus da hepatite C]], virus do [[dengue]]
** Familia ''[[Leviviridae]]''
** Familia ''[[Luteoviridae]]'' - inclúe o [[virus do ananismo anmarelo da cebada]]
** Familia ''[[Narnaviridae]]''
** Familia ''[[Nodaviridae]]''
** Familia ''[[Permutotetraviridae]]''
** Familia ''[[Potyviridae]]''
** Familia ''[[Togaviridae]]'' - inclúe o virus da [[rubéola]], [[virus do río Ross]], [[virus Sindbis]], [[virus Chikungunya]]
** Familia ''[[Tombusviridae]]''
** Familia ''[[Virgaviridae]]''<ref name=Adams2009>{{cite journal | author = Adams MJ, Antoniw JF, Kreuze J | year = 2009 | title = Virgaviridae: a new family of rod-shaped plant viruses | url = | journal = Arch Virol | volume = 154 | issue = 12| pages = 1967–1972 }}</ref>
 
** Xéneros non asignados
*** Xénero ''[[Benyvirus]]''
*** Xénero ''[[Cilevirus]]''
*** Xénero ''[[Hepevirus]]'' - inclúe o virus da [[hepatite E]]
*** Xénero ''[[Idaeovirus]]''
*** Xénero ''[[Negevirus]]
*** Xénero ''[[Ourmiavirus]]''
*** Xénero ''[[Polemovirus]]''
*** Xénero ''[[Sobemovirus]]''
*** Xénero ''[[Umbravirus]]''
 
** Especies non asignadas
*** [[Virus da mancha en anel necrótica do arando]]
*** [[Virus F de Botrytis]]
*** [[Picodicistrovirus canino]]
*** [[Virus satélite asociado á parálise crónica da abella]]
*** [[Virus pequeno extra]]
*** [[Virus ARN de Heterocapsa circularisquama]]
*** [[Virus da mosca do quelpo]]
*** [[Virus Le Blanc]]
*** [[Virus Orsay]]
*** [[Virus Santeuil]]
*** [[Virus 2 de Solenopsis invicta]]
*** [[Virus 3 de Solenopsis invicta]]
 
== Grupo V - Virus de ARN monocatenario de sentido negativo ((-)ssRNA) ==
 
Comprende dúas ordes e oito familias recoñecidas. Tamén hai varias especies e xéneros non asignados.
 
* Orde ''[[Mononegavirales]]''
** Familia ''[[Bornaviridae]]'' - [[virus da enfermidade Borna]]
** Familia ''[[Filoviridae]]'' - inclúe o [[virus Ebola]], [[virus Marburg]]
** Familia ''[[Paramyxoviridae]]'' - inclúe o virus do [[sarampelo]], [[virus das papeiras]], [[virus Nipah]], [[virus Hendra]]
** Familia ''[[Rhabdoviridae]]'' - inclúe o [[virus da rabia]]
 
* Familias non asignadas:
** Familia ''[[Arenaviridae]]'' - inclúe o [[virus Lassa]]
** Familia ''[[Bunyaviridae]]'' - inclúe o [[Hantavirus]], o virus da [[febre hemorráxica Crimea-Congo]]
** Familia ''[[Ophioviridae]]'''
** Familia ''[[Orthomyxoviridae]]'' - inclúe o virus da [[gripe]]
 
* Xéneros non asignados:
** Xénero ''[[Deltavirus]]''
** Xénero ''[[Emaravirus]]''
** Xénero ''[[Nyavirus]]''<ref name="Mihindukulasuriya2009">Mihindukulasuriya K.A., Nguyen N.L., Wu G., Huang H.V., Travassos da Rosa A.P., Popov V.L., Tesh R.B., Wang D. (2009) Nyamanini and Midway viruses define a novel taxon of RNA viruses in the order Mononegavirales. J. Virol.</ref> - inclúe os virus Nyamanini e Midway
** Xénero ''[[Tenuivirus]]''
 
* Especies non asignadas:
** [[Virus das manchas das orquídeas]]
** [[Virus taastrup]]
 
<small>Fonte:<ref name=Klein/></small>
 
== Virus fúnxicos ==
 
A maioría dos virus fúnxicos son virus de ARN de dobre cadea. Tamén se describiu un pequeno número de virus fúnxicos de ARN de sentido positivo. Suxeriuse a posibilidade de que existan tamén virus fúnxicos de cadea negativa.<ref name=Kondo2012>Kondo H, Chiba S, Toyoda K, Suzuki N (2012) Evidence for negative-strand RNA virus infection in fungi. Virology pii: S0042-6822(12)00500-4. doi: 10.1016/j.virol.2012.10.002</ref>
 
== Notas ==
{{Listaref}}
 
== Véxase tamén ==
=== Outos artigos ===
* [[Virus]]
* [[Clasificación dos virus]]
* [[Retrovirus]]
* [[Virus de ADN]]
* [[Febre hemorráxica viral]]
 
=== Ligazóns externas ===
* MeshName - RNA+Viruses - 3=RNA Viruses [http://www.nlm.nih.gov/cgi/mesh/2011/MB_cgi?mode=&term=RNA+Viruses]
* [http://www.horizonpress.com/gateway/animal-viruses.html Virus animais]
 
{{Clasificación de Baltimore}}
393.002

edicións