Elemento SECIS: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
m Bot: Cambio o modelo: Cite journal; cambios estética
Liña 1:
[[Ficheiro:RF00031.jpg|miniatura|dereita|Estrutura secundaria predita e conservación da secuencia (con código de cores) do SECIS_1 de eucariotas.]]
En [[bioloxía]], un '''elemento SECIS''' (do inglés '''''se'''leno'''c'''ysteine '''i'''nsertion '''s'''equence'', secuencia de inserción de selenocisteína) é unha [[secuencia regulatoria]] de ARN duns 60 [[nucleótido]]s de longo cunha estrutura de [[talo-bucle]]. <ref>{{citeCita publicación journalperiódica | last = Walczak | first = R | coauthors = Westhof E, Carbon P, Krol A | year = 1996 | title = A novel RNA structural motif in the selenocysteine insertion element of eukaryotic selenoprotein mRNAs | journal = RNA | volume = 2 | pages = 367&ndash;379 | pmid = 8634917 | issue = 4 | pmc = 1369379}}</ref> Este motivo estrutural (patrón de nucleótidos) dirixe a [[tradución (proteínas)|tradución]] na célula do [[codón]] UGA como [[selenocisteína]]. O codón UGA normalmente funciona como [[codón de terminación]], e a selenocisteína é un [[aminoácido]] especial non codificado directamente no [[código xenético]]. Os elementos SECIS son unha característica fundamental dos [[ARN mensaxeiro]]s que codifican [[selenoproteína]]s (proteínas que conteñen un ou máis residuos de selenocisteína).
 
Nas [[bacteria]]s o elemento SECIS está situado pouco despois do codón UGA ao que afecta. Nas [[arquea]]s e [[célula eucariótica|eucariotaeucariotas]]s aparece na rexión [[3' UTR]] dos [[ARNm]], e pode facer que múltiples codóns UGA do ARNm pasen a codificar selenocisteína. Atopouse un elemento SECIS de arqueas, en ''[[Methanococcus]],'' que está localizado na rexión [[5' UTR]].
 
O elemento SECIS está definido polas características da súa secuencia, é dicir, determinados nucleótidos tenden a ocupar determinadas posicións nel, e ten unha estrutura secundaria característica. A estrutura secundaria é o resultado do emparellamento de bases complementarias dos nucleótidos do [[ARN]], e causa a formación dunha estrutura similar a unha forquita. O elemento SECIS eucariótico inclúe [[par de bases|pares de bases]] [[adenina|A]]-[[guanina|G]] non canónicos, o cal é pouco común na natureza, pero que son fundamentais para o funcionamento correcto do elemento SECIS. Aínda que os elementos SECIS de eucariotas, arqueas e bacterias comparten a mesma estrutura xeral en forquita, non son todos aliñables; por exemplo, un esquema baseado no [[aliñamento de secuencias|aliñamento]] para recoñecer os elementos SECIS eucarióticos non serviría para recoñecer un elemento SECIS de arqueas.
 
En [[bioinformática]], creáronse varios programas informáticos para buscar elementos SECIS nun [[xenoma]], baseados na secuencia e estrutura secundaria característica destes elementos. Estes programas utilizáronse na procura de novas [[selenoproteína]]s. <ref name="pmid=12458087">{{citeCita journalpublicación periódica | last = Lambert | first = A | coauthors = Lescure A, Gautheret D | year = 2002 | title = A survey of metazoan selenocysteine insertion sequences | journal = Biochimie | volume = 84 | pages = 953&ndash;959 | pmid = 12458087 | doi = 10.1016/S0300-9084(02)01441-4 | issue = 9}}</ref>
 
== Distribución nas especies ==
Os elementos SECIS encóntranse nunha grande variedade de organismos pertencentes aos tres dominios da vida (incluíndo os seus virus). <ref name="pmid=12458087"/><ref name="pmid17169995">{{citeCita journalpublicación periódica | author = Mix H, Lobanov AV, Gladyshev VN | title = SECIS elements in the coding regions of selenoprotein transcripts are functional in higher eukaryotes | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 35 | issue = 2 | pages = 414–23 | year = 2007 | pmid = 17169995 | doi = 10.1093/nar/gkl1060 | pmc = 1802603 }}</ref><ref name="pmid16766053">{{citeCita journalpublicación periódica | author = Cassago A, Rodrigues EM, Prieto EL, ''et al.'' | title = Identification of Leishmania selenoproteins and SECIS element | journal = Mol. Biochem. Parasitol. | volume = 149 | issue = 2 | pages = 128–34 | year = 2006 | pmid = 16766053 | doi = 10.1016/j.molbiopara.2006.05.002 }}</ref><ref name="pmid15659354">{{citeCita journalpublicación periódica | author = Mourier T, Pain A, Barrell B, Griffiths-Jones S | title = A selenocysteine tRNA and SECIS element in Plasmodium falciparum | journal = RNA | volume = 11 | issue = 2 | pages = 119–22 | year = 2005 | pmid = 15659354 | doi = 10.1261/rna.7185605 | pmc = 1370700 }}</ref><ref name="pmid=12775843">{{citeCita journalpublicación periódica | author=G. V. Kryukov, S. Castellano, S. V. Novoselov, A. V. Lobanov, O. Zehtab, R. Guigó, and V. N. Gladyshev | title=Characterization of mammalian selenoproteomes | journal=Science | year=2003 | volume=300 | issue=5624 | pages= 1439–1443 | doi=10.1126/science.1083516 | pmid=12775843}}</ref><ref name="pmid=15105824">{{citeCita journalpublicación periódica | author=Gregory V. Kryukov and Vadim N. Gladyshev | title=The prokaryotic selenoproteome | journal=EMBO Rep | year=2004 | volume=5 | issue=5 | pages= 538–543 | doi=10.1038/sj.embor.7400126 | pmid=15105824 | pmc=1299047}}</ref><ref name="pmid=12457564">{{citeCita journalpublicación periódica | author=Alain Krol | title=Evolutionarily different RNA motifs and RNA-protein complexes to achieve selenoprotein synthesis | journal=Biochimie | year=2002 | volume=84 | issue=8 | pages= 765–774 | doi=10.1016/S0300-9084(02)01405-0 | pmid=12457564}}</ref>
 
== Notas ==
{{listaref|1}}
 
== Véxase tamén ==
=== Outros artigos ===
* [[Elemento PYLIS]]
* [[Selenocisteína]]
* [[Elemento regulador en cis]]
 
=== Ligazóns externas ===
* [http://mrna.otago.ac.nz/cgi-bin/tt_data_browse/RNAMotif?PatID=T0103 Transterm page for SECIS Element]